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Enregistrement W4234257941 · doi:10.1101/2020.02.15.20023374

<i>SMPD1</i> variants do not have a major role in REM sleep behavior disorder

2020· preprint· en· W4234257941 sur OpenAlexafffund
Uladzislau Rudakou, Naomi C. Futhey, Lynne Krohn, Jennifer A. Ruskey, Karl Heilbron, Paul Cannon, Armaghan Alam, Isabelle Arnulf, Jacques Montplaisir, Jean‐François Gagnon, Alex Désautels, Yves Dauvilliers, Marco Toffoli, Gian Luigi Gigli, Mariarosaria Valente, Birgit Högl, Ambra Stefani, Evi Holzknecht, Karel Šonka, David Kemlink, Wolfang Oertel, Annette Janzen, Giuseppe Plazzi, Elena Antelmi, Michela Figorilli, Monica Puligheddu, Brit Mollenhauer, Claudia Trenkwalder, Friederike Sixel‐Döring, Valérie Cochen De Cock, Christelle Monaca, Anna Heidbreder, Luigi Ferini‐Strambi, Femke Dijkstra, Mineke Viaene, Beatriz Abril, Bradley F. Boeve, Ronald B. Postuma, Guy A. Rouleau, Ziv Gan‐Or

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalUniversité de MontréalHôpital du Sacré-Cœur de MontréalMcGill UniversityCanadian Sleep & Circadian NetworkMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanada First Research Excellence FundConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementParkinson CanadaMcGill UniversityMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésREM sleep behavior disorderDementia with Lewy bodiesLogistic regressionGlucocerebrosidaseParkinson's diseaseGeneticsDiseaseBiologyPsychologyMedicineInternal medicineDementiaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mutations in the sphingomyelin phosphodiesterase 1 ( SMPD1 ) gene were reported to be associated with Parkinson disease (PD) and dementia with Lewy bodies (DLB). The majority of patients with isolated rapid eye movement sleep behavior disorder (iRBD) develop PD or DLB later in life, suggesting that iRBD is a prodromal phase of these two conditions. In the current study we aimed to evaluate the role of SMPD1 variants in iRBD. SMPD1 and its untranslated regions were sequenced using targeted next-generation sequencing in 959 iRBD patients and 1,287 controls from European descent. Logistic regression adjusted for sex and age showed no significant associations with two common variants and iRBD (rs1050239 and rs8164). The frequency of all rare nonsynonymous SMPD1 variants (minor allele frequency <1%) was found to be twice as high in cases than in controls (1.46% vs. 0.70%, Fisher’s exact test p=0 . 09 ) but there was no statistically significant burden ( p=0 . 64 ). Our study reports no statistically significant association of SMPD1 variants and iRBD. It is hence unlikely that SMPD1 plays a major role in iRBD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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