Unique Combinations of βαβ-Units and Π-Like Modules in Proteins and Specific Features of Their Amino Acid Sequences
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Notice bibliographique
Résumé
Possible combinations of βαβ-units and Π-like modules in proteins in both right- and left-handed forms have been analyzed in detail. The correlation between the mutual arrangement of the structural elements in the polypeptide chain and their handedness has been shown. In the βαβΠ combinations, which is encountered most frequently in proteins, the Π-module follows the βαβ unit along the chain and both elements are right-handed. In the Πβαβ combinations, where the Π-module is located at the N end and the βαβ-unit follows it, the former is left-handed and the latter is right-handed. In relatively rare combinations of the left-handed βαβ-units and right-handed Π-modules, the βαβ-unit follows Π-module in the chain. The combinations of left-handed Π-modules and the left-handed βαβ-units are unobservable in proteins. It has also been shown that the Π-modules with a β-strand—α-helix—arch—β-strand structure are observed in proteins only in a right-handed form and half of them (51%) contains cis -prolines in their arches. These arches of nonhomologous proteins, as well as the positions of cis -prolines, nearly coincide when superimposed. The superimposed Π-modules also demonstrate that their overall folds are very similar. Structural alignment of their amino acid sequences has shown that the Π-modules have very similar sequence patterns of the key hydrophobic, hydrophilic, glycine, and cis -proline residues.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle