Faculty Opinions recommendation of CRISPR screens identify genomic ribonucleotides as a source of PARP-trapping lesions.
Notice bibliographique
Résumé
Results of PARP inhibitor CRISPR screens, source data for mouse xenograft experiments, unprocessed images of immunoblots and examples of gating strategies for FACS experiments are provided as Supplementary Information.All other datasets generated during this study are available from the corresponding authors upon reasonable request.Author contributions MZ performed the initial CRISPR screens with the help of MA, AM, MC, SA and JM; TH analyzed the data.MZ and OM performed suppressor screens; AM helped with data analysis.Unless otherwise stated, MZ and OM, with input from MAMR, performed all additional experiments and data analysis.MAMR performed biochemical characterization of RER-deficient RNase H2, and together with ŽT and AF contributed to the generation of HeLa and HCT116 RNASEH2A-KO cell lines.AA, under the supervision of TS, conducted ex-vivo CLL studies and CGH arrays.SP and PM clinically characterized CLL patients and provided CLL blood samples.RC performed MLPA assays.WY, MC and ML, under the supervision of JB, analysed CNA in the RB1-RNASEH2B region in CRPCs.MM and OM, under the supervision of VGB, conducted xenograft experiments.APJ and DD designed and directed the study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,095 | 0,067 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».