Peer Review #1 of "Sociality genes are associated with human-directed social behaviour in golden and Labrador retriever dogs (v0.1)"
Notice bibliographique
Résumé
Background.Dogs have human-directed social skills that allow them to communicate and cooperate with humans.We have previously identified two loci on chromosome 26 associated with human contactseeking behaviours during an unsolvable problem task in laboratory beagles (Persson et al., 2016).The aim of the present study was to verify the SNPs in additional dog breeds and investigate possible associations to other social skills.We also studied how the allele frequencies have changed during domestication and recent selection.Methods.Dogs of two breeds, 61 golden retrievers and 100 Labrador retrievers, were phenotyped and genotyped, and 19 wolves were genotyped.The Labrador retrievers were divided into common and field type by pedigree data to make it possible to study the effects of recent selection.All dogs were tested in an unsolvable problem task where human-directed social behaviours were scored.DNA from dogs (buccal swabs) and wolves (blood or brain tissue) was analysed for genotype on two of the previously identified SNP markers, BICF2G630798942 (SNP1) and BICF2S23712114 (SNP2), by pyrosequencing. Results.There was genetic variation for SNP1 in both dog breeds whereas the wolves were fixed for this polymorphism, and for SNP2 there was variation in both dogs and wolves.For both SNPs, Labrador retriever types differed significantly in allele frequencies.We found associations between SNPs and human-directed social behaviour in both dog breeds.In golden retrievers, SNP1 was associated with physical contact variables, for example with the duration of physical contact with the owner (F 2,56 = 4.389, p = 0.017).SNP2 was associated with several behavioural variables in both breeds, among others owner gazing frequency in both golden retrievers (F 2,55 = 6.330, p = 0.003) and Labradors (F 1,93 = 5.209, p = 0.025). Discussion.Our results verify the association between the previously identified SNPs and humandirected social behaviour scored in an unsolvable problem task.Differences in allele frequencies suggest that these loci have been affected by selection.The results suggest that these genomic regions are involved in human-directed social behaviour in not only beagles but in other dog breeds as well.We hypothesise that they may have been important during dog domestication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,068 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,272 | 0,111 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».