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Enregistrement W4234847975 · doi:10.1093/biolreprod/85.s1.403

GATA4 Autoregulates Its Own Expression in Gonadal Cells via Its Distal 1b Promoter.

2011· article· en· W4234847975 sur OpenAlexaff
Bruno Prud’homme, Severine Mazaud Guittot, Hiroaki Taniguchi, Caroline Daems, Marie France Bouchard, Robert S. Viger

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGATA4ExonPromoterTranscription factorGeneticsGeneUntranslated regionSomatic cellCell biologyGene expressionMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GATA4 is an essential transcription factor required for the development and function of multiple tissues derived from both mesoderm and endoderm. Among these tissues, GATA4 is highly expressed in the somatic cell lineages of the gonads in both sexes throughout development. Various knockout models in mice have demonstrated that GATA4 is essential for the onset of normal gonadal morphogenesis and is later recruited as a key regulator of numerous genes (e.g., Star, Cyp19a1, Inha) in response to hormonal cell signaling. Very recent evidence in the literature also supports a role for GATA4 in human gonadal development, at least in the male. In spite of its essential biological functions, the factors and mechanisms that control GATA4 expression have yet to be fully understood. We have shown that humans and rodents express the GATA4 gene as multiple transcript variants that differ solely in their untranslated first exons. The most frequently used first exons are exon 1a, which is closest to the ATG and driven by the proximal 1a promoter, and exon 1b whose usage is controlled by an alternative distal promoter (named 1b) that is approximately 30 kb further upstream. Since all GATA4 transcript variants produce the same GATA4 protein, our hypothesis is that differential promoter usage is an important mechanism for regulating spatiotemporal GATA4 expression in the gonads and possibly other tissues. Our previous work demonstrated that a conserved E-box motif in the proximal 1a promoter is essential for its activity both in vitro and in vivo. Using in situ hybridization, we now show that the Gata4 1b transcripts are also present in the somatic cell lineages of the developing testis and ovary. We also show, using quantitative real-time PCR (qPCR) that the Gata4 1b transcript is present in several gonadal cell lines (MSC-1, TM3, TM4, MA-10, DC3), albeit less abundant than the Gata4 1a transcript. Consistent with this observation, transient transfection studies revealed that the Gata4 1b regulatory region was less active than the Gata4 1a promoter in all cell lines tested. Progressive 5' deletion analysis of the Gata4 1b promoter showed that regulatory elements required for its activity are located in the first 171 bp. This region contains two conserved binding motifs for GATA family members (conserved at least in mouse, rat and human). Both motifs actively bind GATA4 protein as revealed by electrophoretic mobility shift assay (EMSA). The -171 bp Gata4 1b promoter was stimulated 3 to 7-fold by GATA4 in homologous and heterologous cells, respectively. Site-directed mutagenesis of both GATA motifs abolished GATA4-dependent activation of the 1b promoter. Finally, knockdown of GATA4 expression in MA-10 cells by siRNA also led to a marked drop in Gata4 1b promoter activity. Therefore, unlike the Gata4 1a promoter, which is regulated by ubiquitous factors binding to an E-box element, our present data suggest that GATA4 can also autoregulate its expression at the level of its distal 1b promoter. This represents a potentially key mechanism for regulating GATA4 expression in different cell types and at different timepoints during development. This research was supported by CIHR grant MOP-14796 to RSV. (poster)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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Résumé présentoui

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