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Enregistrement W4235171669 · doi:10.1002/9781118960608.gbm00797.pub2

<i>Methylocella</i>

2016· other· en· W4235171669 sur OpenAlexaff
Svetlana N. Dedysh, Peter F. Dunfield

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2016
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethane monooxygenaseMethanotrophBacteriaAlphaproteobacteriaChemistryAnaerobic oxidation of methaneMethaneBiochemistryFormateEnvironmental chemistryBiologyOrganic chemistry16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Me.thy.lo.cel'la. N.L. pref. methylo pertaining to the methyl radical; L. fem. n. cella a room, and in biology, a cell; N.L. fem. n. Methylocella a methane‐using cell. The genus Methylocella accommodates mildly acidophilic, facultatively methanotrophic bacteria that perform the first step of methane oxidation using only a soluble methane monooxygenase, rather than the more common particulate methane monooxygenase. Cells of these methanotrophs are Gram‐negative, aerobic, non‐motile, polymorphic, slightly curved rods or ovoids, which reproduce by normal cell division and occur singly or in in shapeless aggregates. Cells possess bipolar appearance due to large, highly refractile, intracellular poly‐β‐hydroxybutyrate granules, which form at each cell pole one. An extensive intracytoplasmic membrane system common to most known methanotrophic bacteria is absent from cells. Like other methanotrophs, Methylocella species are capable of growth on methane, methanol, methylamine and formate; C 1 compounds are assimilated via the serine pathway. However, they are also capable of growth on ethanol, some organic acids, ethane, propane and some other multicarbon compounds, but sugars are not utilized. Acetate is preferred over methane, and leads to a downregulation of methane oxidation. These methanotrophs are capable of atmospheric nitrogen fixation under reduced oxygen tension. They are mesophilic and psychrotolerant bacteria, which prefer dilute media of low salt content. The major fatty acid is ω7 c . DNA G + C content is 61.2–63.3 (T m ). Known habitats are acidic and neutral peatlands, soils, and sediments. Type species : Methylocella palustris Dedysh, Liesack, Khmelenina, Suzina, Trotsenko, Semrau, Bares, Panikov, and Tiedje 2000, 967 VP . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Methylocella is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Alphaproteobacteria / Hyphomicrobiales / Beijerinckiaceae / Methylocella The genus Methylocella can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Methylocella (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Alphaproteobacteria / o__Rhizobiales / f__Beijerinckiaceae / g__Methylocella * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D785 – D794 ; DOI: 10.1093/nar/gkab776

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,331
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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