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Enregistrement W4235475498 · doi:10.1534/g3.118.200213

Role of Translesion Synthesis DNA Polymerases in DNA Replication in the Presence of a Weak DNA Polymerase δ in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>

2018· article· en· W4235475498 sur OpenAlexaboutno aff
Likui Zhang, Yanchao Huang, Xinyuan Zhu, Yuxiao Wang, Haoqiang Shi, Min Chen, Kunming Dong, Xiaojian Zhou

Notice bibliographique

RevueG3 Genes Genomes Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA polymeraseDNA polymerase IIDNA clampDNA replicationPolymeraseDNA polymerase deltaEukaryotic DNA replicationSaccharomyces cerevisiaeDNA polymerase muDNADNA synthesisBiologyCell biologyGeneticsChemistryMolecular biologyCircular bacterial chromosomePolymerase chain reactionGeneReverse transcriptase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This retraction has been requested by the corresponding author Likui Zhang, citing authorship concerns detailed below. The article (10.1534/g3.117.300097) was submitted and approved for publication without proper acknowledgement of funding, experiment design, data interpretation, and manuscript contributions contributed by Dr. Linda Reha-Krantz of the University of Alberta, Canada and additional research personnel and several students. All work by Dr. Zhang was done under the supervision of Dr. Reha-Krantz in Reha-Krantz’s lab, the experiments designed by Reha-Krantz, and the research funded by Reha-Krantz’s grants. Dr. Zhang was involved with the research as a Postdoctoral Scholar in Dr. Reha-Krantz’s lab and shared in the research with Alina Radziwon and RanRan Zhang who constructed the mutant strains. Dr. Linda Reha-Krantz has declined to be listed as an author due to various concerns, which had been shared with Dr. Zhang. Additionally, the authors listed on the early online version of the paper do not meet authorship criteria for G3: Genes|Genomes|Genetics, which was discovered by G3 post-publication after Dr. Zhang’s requested removal of the authors. Both Dr. Zhang and G3 apologize to our readers for any inconvenience caused by this retraction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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