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Enregistrement W4235663125 · doi:10.1016/s0928-8244(00)00207-8

Identification of a novel antigen from Staphylococcus epidermidis

2000· article· en· W4235663125 sur OpenAlexfundno aff
Sue Lang

Notice bibliographique

RevueFEMS Immunology & Medical Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesQueen's UniversityBritish Heart Foundation
Mots-clésStaphylococcus epidermidisMicrobiologyBiologyStaphylococcus aureusVirulenceAntigenEndocarditisStaphylococcal infectionsStaphylococcusWestern blotAntibodyVirologyBacteriaGeneImmunologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A genomic DNA library of Staphylococcus epidermidis NCTC 11047 was constructed, using the Lambda Zap Express cloning vector, and screened with serum collected from a patient with S. epidermidis endocarditis. Sequence analysis of a 30 kDa cloned protein, termed staphylococcal secretory antigen, SsaA, identified a novel protein not previously reported in S. epidermidis. SsaA showed strong homology with two other staphylococcal proteins: SceB from Staphylococcus carnosus and a staphyloxanthin biosynthesis protein from Staphylococcus aureus. Further investigation revealed SsaA to be a highly antigenic protein that was expressed in vivo and could be recovered from whole cells and from the culture supernatant. A combination of Western blot analysis and PCR screening identified SsaA or a homologue in 103/103 staphylococcal strains. SsaA-like genes were not detected in other Gram-positive bacteria of medical importance or a number of Gram-negative organisms. Elevated anti-SsaA IgG antibody levels were detected in sera of five patients with S. epidermidis endocarditis but not in patients with other S. epidermidis infections, endocarditis of other aetiologies or patients with no evidence of infection. The expression of SsaA during episodes of S. epidermidis endocarditis suggests a virulence role specific to the pathogenesis of this infectious disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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