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Enregistrement W4235731545 · doi:10.1093/ofid/ofy209.172

2564. Clinical Validation of a Commercial LAMP Test for Ruling Out Malaria in Returning Travelers: A Prospective Diagnostic Trial

2018· article· en· W4235731545 sur OpenAlexaffabout
James Cheaveau, Hong Nguyen, Barbara L. Chow, Hong Zhou, Abu Naser Mohon, Giselle Maria Rachid Viana, Wilson Chan, Dylan R. Pillai

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensProvincial Laboratory of Public HealthCalgary Laboratory ServicesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineMalariaProspective cohort studyRapid diagnostic testPlasmodium malariaeInternal medicineDiagnostic testSurgeryPlasmodium vivaxPlasmodium falciparumPathologyPediatrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The mainstay of malaria diagnosis relies on rapid diagnostic tests (RDT) and Giemsa-stained microscopy both of which lack analytical sensitivity. This leads to repeat testing to rule out malaria. Nucleic acid amplification (NAT) methods are more sensitive, but testing requires technical proficiency beyond the average clinical laboratory. Methods We conducted a prospective diagnostic trial of the Meridian illumigene Malaria assay (LAMP) compared with reference microscopy and RDT (BinaxNOW Malaria) in returning travelers in Western Canada between June 2017 and January 2018. Returning travelers with signs and symptoms of fever were enrolled into the study. RDT, microscopy, and LAMP assays were performed simultaneously. To increase the yield of positive specimens for all species of malaria, retrospective specimens of Plasmodium vivax, P. ovale, and P. malariae species were supplemented. Real-time (RT)–PCR testing was performed on all specimens to resolve discrepancies. A cost–benefit analysis was performed. Results A total of 296 consecutive patients (50.7% male, mean age 32.5) were enrolled, most visiting friends and relatives (43.2%), traveling to Asia (48.4%), presenting with fever (88.9%), not taking prophylaxis (82.8%), and treated as outpatients (84.3%). In the prospective arm, LAMP had a sensitivity of 98.1% (95% CI 89.9–99.9) and a specificity of 97.6% (95% CI 95.2–99.0) versus microscopy. After discrepant resolution with RTPCR, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI 93.9–100) and a specificity of 100% (95% CI 98.7–100) versus microscopy. When including retrospective specimens, LAMP had a sensitivity of 98.7% (95% CI 92.7–99.9) and a specificity of 97.6% (95% CI 95.2–99.1) versus microscopy, and after discrepant resolution of this set, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI 95.5–100) and a specificity of 100% (95% CI 98.7–100). The rate of invalid tests with LAMP was 3.05%. After discrepant resolution, RDT had a sensitivity of 83.3% (95% CI 58.6–96.4) and a specificity of 96.2% (95% CI 93.2–98.1) versus microscopy. A cost–benefit analysis of reagents and labor suggests up to USD 13 savings per specimen using a revised algorithm with LAMP screening. Conclusion A novel, highly sensitive testing algorithm for malaria screening with associated cost savings in the nonendemic setting is proposed. Disclosures D. Pillai, Meridian Biosciences: None, Diagnostic testing material for study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,147
Score d'incertitude au seuil0,986

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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