2564. Clinical Validation of a Commercial LAMP Test for Ruling Out Malaria in Returning Travelers: A Prospective Diagnostic Trial
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The mainstay of malaria diagnosis relies on rapid diagnostic tests (RDT) and Giemsa-stained microscopy both of which lack analytical sensitivity. This leads to repeat testing to rule out malaria. Nucleic acid amplification (NAT) methods are more sensitive, but testing requires technical proficiency beyond the average clinical laboratory. Methods We conducted a prospective diagnostic trial of the Meridian illumigene Malaria assay (LAMP) compared with reference microscopy and RDT (BinaxNOW Malaria) in returning travelers in Western Canada between June 2017 and January 2018. Returning travelers with signs and symptoms of fever were enrolled into the study. RDT, microscopy, and LAMP assays were performed simultaneously. To increase the yield of positive specimens for all species of malaria, retrospective specimens of Plasmodium vivax, P. ovale, and P. malariae species were supplemented. Real-time (RT)–PCR testing was performed on all specimens to resolve discrepancies. A cost–benefit analysis was performed. Results A total of 296 consecutive patients (50.7% male, mean age 32.5) were enrolled, most visiting friends and relatives (43.2%), traveling to Asia (48.4%), presenting with fever (88.9%), not taking prophylaxis (82.8%), and treated as outpatients (84.3%). In the prospective arm, LAMP had a sensitivity of 98.1% (95% CI 89.9–99.9) and a specificity of 97.6% (95% CI 95.2–99.0) versus microscopy. After discrepant resolution with RTPCR, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI 93.9–100) and a specificity of 100% (95% CI 98.7–100) versus microscopy. When including retrospective specimens, LAMP had a sensitivity of 98.7% (95% CI 92.7–99.9) and a specificity of 97.6% (95% CI 95.2–99.1) versus microscopy, and after discrepant resolution of this set, LAMP had a sensitivity of 100% (95% CI 95.5–100) and a specificity of 100% (95% CI 98.7–100). The rate of invalid tests with LAMP was 3.05%. After discrepant resolution, RDT had a sensitivity of 83.3% (95% CI 58.6–96.4) and a specificity of 96.2% (95% CI 93.2–98.1) versus microscopy. A cost–benefit analysis of reagents and labor suggests up to USD 13 savings per specimen using a revised algorithm with LAMP screening. Conclusion A novel, highly sensitive testing algorithm for malaria screening with associated cost savings in the nonendemic setting is proposed. Disclosures D. Pillai, Meridian Biosciences: None, Diagnostic testing material for study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,015 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».