Pseudothermotoga
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Pseu.do.ther.mo.to'ga. Gr. adj. pseudo , false; N.L. fem. n. Thermotoga, a bacterial genus; N.L. fem. n. Pseudothermotoga, a genus falsely (or incorrectly) classified as Thermotoga . The genus Pseudothermotoga comprises sheathed, thermophilic, anaerobic, fermentative, and hydrogen‐producing bacteria. Thiosulfate is reduced by all the strains of the genus. Pseudothermotoga spp. are members of the phylum Thermotogota , class Thermotogae, order Thermotogales , family Thermotogaceae . Known habitats are hot springs, oil reservoirs, and thermophilic bioreactors. Genome sizes are in the range 2.01–2.19 Mb, and GC content varies between 38.7 and 51.3%. Based on phylogenomic analyses, two recently described species, Thermotoga profunda and Thermotoga caldifontis, should be assigned to the recently described genus Pseudothermotoga . Based on DNA–DNA hybridization and various genomic measurements, the Pseudothermotoga lettingae and Pseudothermotoga subterranea species should be reclassified as subspecies of Pseudothermotoga elfii . With these proposed reclassifications, the genus Pseudothermotoga would consist of five described species: Pseudothermotoga thermarum, Pseudothermotoga elfii, Pseudothermotoga hypogea, Pseudothermotoga Profunda, and Pseudothermotoga caldifontis . However, high genomic divergence observed within this genus may require additional taxonomic revisions in the future. DNA G + C content (mol%) : 38.7–51.3. Type species : Pseudothermotoga thermarum Bhandari and Gupta, 2014, VL158 (Basonym: Thermotoga thermarum, Windberger et al. 1989 ). Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Pseudothermotoga is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Thermotogales / Thermotogaceae / Pseudothermotoga The genus Pseudothermotoga can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Pseudothermotoga (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Thermotogales / f__DSM-5069 / g__Pseudothermotoga * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,010 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».