Peer Review #3 of "Rhizobacterial communities of five co-occurring desert halophytes (v0.3)"
Notice bibliographique
Résumé
Background: Recently, researches have begun to investigate the microbial communities associated with halophytes.Both rhizobacterial community composition and the environmental drivers of community assembly have been addressed.However, few studies have explored the structure of rhizobacterial communities associated with halophytic plants that are co-occurring in arid, salinized areas.Methods: Five halophytes were selected for study: these co-occurred in saline soils in the Ebinur Lake Nature Reserve, located at the western margin of the Gurbantunggut Desert of Northwestern China.Halophyte-associated bacterial communities were sampled, and the bacterial 16S rDNA V3-V4 region amplified and sequenced using the Illumina Miseq platform.The bacterial community diversity and structure were compared between the rhizosphere and bulk soils, as well as among the rhizosphere samples.The effects of plant species identity and soil properties on the bacterial communities were also analyzed.Results: Significant differences were observed between the rhizosphere and bulk soil bacterial communities.Diversity was higher in the rhizosphere than in the bulk soils.Abundant taxonomic groups (from phylum to genus) in the rhizosphere were much more diverse than in bulk soils.Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes and Planctomycetes were the most abundant phyla in the rhizosphere, while Proteobacteria and Firmicutes were common in bulk soils.Overall, the bacterial community composition were not significantly differentiated between the bulk soils of the five plants, but community diversity and structure differed significantly in the rhizosphere.The diversity of Halostachys caspica, Halocnemum strobilaceum and Kalidium foliatum associated communities was lower than that of Limonium gmelinii and Lycium ruthenicum communities.Furthermore, the composition of Halostachys caspica and Halocnemum strobilaceum communities was very PeerJ reviewing
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,054 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,172 | 0,074 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».