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Enregistrement W4237162610 · doi:10.1016/s0021-9258(19)61448-1

3′-Azidothymidine Potently Inhibits the Biosynthesis of Highly Branched N-Linked Oligosaccharides and Poly-N-acetyllactosamine Chains in Cells

2000· article· en· W4237162610 sur OpenAlexaff
Richard Steet, Paul Melançon, Robert D. Kuchta

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiosynthesisChemistryBiochemistryStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies in our laboratory have characterized 3′-azido-3′-deoxythymidine (AZT) as a potent inhibitor of glycosphingolipid biosynthesis in cultured cells (Steet, R., Alizadeh, M., Melançon, P., and Kuchta, R. D. (1999) Glycoconj. J. 16, 237–245; Yan, J.-P., Ilsley, D. D., Frohlick, C., Steet, R., Hall, E. T., Kuchta, R. D., and Melançon, P. (1995) J. Biol. Chem. 270, 22836–22841). Here, we report that AZT treatment of K562 cells results in significant alterations in the profile of N -linked oligosaccharides. Fractionation of [ 3 H]mannose-labeled oligosaccharides from AZT-treated K562 cells using lectin affinity chromatography revealed striking changes in the branching and processing of N -linked glycoconjugates. AZT treatment resulted in the production of fewer highly branched complex glycans (60% of control at 20 μm AZT) and a significant accumulation of core-fucosylated biantennary oligosaccharides. In addition, extension of branched oligosaccharides with multiple poly- N- acetyllactosamine repeats is nearly abolished by AZT concentrations as low as 2 μm. A shift from multiantennary to moderately branched oligosaccharides was also apparent in the melanoma cell line SK-MEL-30 upon AZT treatment. N -Linked glycans from both cell lines exhibited increased affinity for the β-galactoside-binding lectin RCA-I in the presence of AZT, suggesting that the addition of terminal sialic acid is sensitive to the drug. These results demonstrate the ability of AZT to modulate strongly the processing of asparagine-linked glycoconjugates in whole cells and reveal a novel mechanism by which AZT treatment may cause anemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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