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Enregistrement W4237502070 · doi:10.3410/f.737250245.793574136

Faculty Opinions recommendation of Dynamics of Auxilin 1 and GAK in clathrin-mediated traffic.

2020· dataset· en· W4237502070 sur OpenAlexaff
Sergio Grinstein

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaNational Natural Science Foundation of ChinaIonis PharmaceuticalsBiogen
Mots-clésVesicleClathrinPhosphatasePhosphatidylinositolCell biologyDynaminChemistryBiophysicsBiologyKinaseEndocytosisBiochemistryPhosphorylationMembraneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clathrin-coated vesicles lose their clathrin lattice within seconds of pinching off, through the action of the Hsc70 "uncoating ATPase."The J-and PTEN-like domain-containing proteins, auxilin 1 (Aux1) and auxilin 2 (GAK), recruit Hsc70.The PTEN-like domain has no phosphatase activity, but it can recognize phosphatidylinositol phosphate head groups.Aux1 and GAK appear on coated vesicles in successive transient bursts, immediately after dynamin-mediated membrane scission has released the vesicle from the plasma membrane.These bursts contain a very small number of auxilins, and even four to six molecules are sufficient to mediate uncoating.In contrast, we could not detect auxilins in abortive pits or at any time during coated pit assembly.We previously showed that clathrin-coated vesicles have a dynamic phosphoinositide landscape, and we have proposed that lipid head group recognition might determine the timing of Aux1 and GAK appearance.The differential recruitment of Aux1 and GAK correlates with temporal variations in phosphoinositide composition, consistent with a lipidswitch timing mechanism...........

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,144

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0430,043

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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