Propionic Academia: Exome Sequencing Identified Novel Mutation in Exon 12 of PCCA Gene
Notice bibliographique
Résumé
Propionic acidemia (PA) is a rare autosomal recessive genetic disorder resulting from propionyl-coenzyme A carboxylase deficiency. This mitochondrial enzyme is a heterocopolymer of two subunits a and b that are encoded by PCCA and PCCB genes, respectively. The phenotypes of PCCA mutations are most varied ranging from mild to lethal within a few days after birth because there is great heterogeneity in the mutations of PCCA, while PCCB bears only a limited number of mutations. Deep resequencing of all human genes could potentially identify allelic variants involved in a given rare monogenic disease. Whole exome sequencing (WES) is well justified as an efficient strategy to search for mutations in rare Mendelian disorders. Here, we analyzed an Iranian couple with the history of having a child who died probably due to PA by WES. We could report a novel heterozygous non-sense mutation (p.Y380X) in exon 12 of the PCCA gene, resulting in the protein truncation. We could find that both of parents are carrier for a heterozygous novel non-sense mutation in PCCA gene. We showed that WES in parents, along with appropriate filtering against public SNP databases, is sufficient to identify carriers for a known monogenic disorder, PA, in a consanguineous family. J Med Cases. 2017;8(4):111-113 doi: https://doi.org/10.14740/jmc2743e
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».