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Enregistrement W4238455797 · doi:10.1186/ar3963

Abstract withdrawn

2012· article· en· W4238455797 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Arthritis NetworkNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesArthritis SocietyLupus Research AllianceArthritis Foundation
Mots-clésMedicineRheumatologyInternal medicineFamily medicineMedical physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lupus develops when genetically predisposed people encounter environmental agents that initiate flares.Current evidence indicates that the environmental contribution is mediated by T-cell DNA demethylation.DNA methylation patterns are established during differentiation, and silence inappropriate or unnecessary genes by promoting a condensed chromatin configuration that is inaccessible to transcription factors.The methylation patterns are then replicated each time a cell divides by DNA methyltransferase 1 (Dnmt1).Dnmt1 is upregulated during mitosis, binds the replication fork, and catalyzes transfer of the methyl group from S-adenosylmethionine (SAM) to dC bases in the daughter DNA strand only where the parent strand is methylated.Environmental agents that block ERK pathway signaling prevent Dnmt1 upregulation, and low Dnmt1 levels synergize with dietary micronutrient deficiencies that decrease SAM pools to impair methylation of the daughter strand.This activates genes silenced only by DNA methylation.Inhibiting T-cell DNA methylation converts helper CD4 + T cells into autoreactive, cytotoxic, proinflammatory cells that cause lupus-like autoimmunity in mice.Similar changes in CD4 + T-cell DNA methylation and gene expression are found in patients with active lupus.Procainamide and hydralazine, which cause ANAs in a majority of patients and lupus in a genetically predisposed subset, also inhibit T-cell DNA methylation.The lupus T-cell DNA methylation defect has been traced to low Dnmt1 levels caused by decreased ERK pathway signaling, and the signaling defect has now been traced to PKCδ inactivation caused by oxidative damage.The importance of decreased ERK pathway signaling was confirmed by generating a transgenic mouse with an inducible dominant negative MEK. Inducing the signaling defect selectively in T cells decreases Dnmt1, causing anti-DNA antibodies in mice without lupus genes, and higher anti-DNA antibody levels and an immune complex glomerulonephritis in mice with lupus genes.Autoantibody levels and kidney disease are suppressed by dietary transmethylation micronutrient supplementation in these mice.Epigenetic mechanisms also contribute to the gender dimorphism in lupus.Immune genes on the normally silenced X chromosome demethylate in women with active lupus, contributing to flare severity.In contrast, men with only one X chromosome require a greater genetic predisposition and/ or greater degree of DNA demethylation to develop a lupus flare equal in severity to women.Together, these studies indicate that environmental agents including oxidative stress and diet combine to inhibit T-cell DNA methylation, and that the epigenetically modified cells cause lupus-like autoimmunity in genetically predisposed people and mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,251
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7490,625

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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