Faculty Opinions recommendation of The histone variant H3.3 regulates gene expression during lytic infection with herpes simplex virus type 1.
Notice bibliographique
Résumé
It has been proposed that incorporation of the histone variant H3.3 within actively transcribed regions of a genome helps to facilitate transcription. In this report we use lytic infection by herpes simplex virus type 1 (HSV-1) as a model to examine the temporal profile of histone H3 incorporation and to determine whether the variant histone H3.3 has a direct effect on transcription. We find that canonical H3.1 and variant H3.3 exhibit distinct temporal associations with the genome in cell lines expressing equal amounts of epitope-tagged H3 variants. At the earliest times examined after infection, the HSV-1 genome is incorporated into chromatin that predominantly contains the variant H3.3, whereas incorporation of canonical H3.1 occurs later in infection and is dependent on replication of the HSV-1 genome. Further, inhibition of H3.3 association, via reduced expression of the H3.3 chaperone HIRA, significantly reduces the levels of HSV-1 mRNA. These findings show that incorporation of H3.3 facilitates transcription, and they provide new evidence for a regulatory role of chromatin composition during HSV-1 acute infection. PMID: 19004946
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,027 | 0,017 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».