FRET Evidence that an Isoform of Caspase-7 Binds but Does Not Cleave its Substrate
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Notice bibliographique
Résumé
Caspase-7 is one of the executioner proteases in cellular apoptosis. Its kinetics has been monitored using biosensors based on the principle of fluorescence resonance energy transfer (FRET). Here, a caspase-7 biosensor (named vDEVDc) using fluorescent proteins as the donor and acceptor of FRET was used to study the biochemical properties of caspase-7. An active isoform of caspase-7 with the 56 N-terminal residues truncated (named 57casp7) cleaved the vDEVDc biosensor at the recognition sequence, resulting in a FRET efficiency decrease of 61%. In contrast, another caspase-7 isoform with the 23 N-terminal residues truncated (named 24casp7) bound the vDEVDc biosensor without cleaving the substrate, resulting in a FRET increase of 15%. The kinetics of the two caspase-7 isoforms were studied by monitoring the FRET change of the vDEVDc biosensor over time, which showed an exponential substrate cleavage and binding curve for the 57casp7 and 24casp7 isoform, respectively. Lastly, we modeled caspase-7 binding to the vDEVDc biosensor and estimated a FRET emission ratio increase of 16.2% after binding to caspase-7, which agrees with the 15% experimental result. We showed that two isoforms of caspase-7 with differently truncated prodomain exhibit different enzymatic properties, namely binding by the 24casp7 isoform and hydrolysis by 57casp7. We also demonstrated that our FRET biosensor (vDEVDc) can be used to detect not only the substrate cleavage event, but also the substrate binding event
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle