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Enregistrement W4238690304 · doi:10.3410/f.1116587.572629

Faculty Opinions recommendation of Association of variants in the fat mass and obesity associated (FTO) gene with polycystic ovary syndrome.

2008· dataset· en· W4238690304 sur OpenAlexaff
Robert F. Casper, Yaakov Bentov

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2008
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolycystic ovaryFTO geneObesityBody mass indexMedicineInternal medicineEndocrinologyFree androgen indexGenotypeAndrogenOdds ratioMinor allele frequencyCase-control studyEtiologyCohortType 2 diabetesDiabetes mellitusAllele frequencyInsulin resistancePolymorphism (computer science)BiologyHormoneGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS/HYPOTHESIS: Variants in the fat-mass and obesity-associated gene (FTO) influence susceptibility to type 2 diabetes via an effect on adiposity/obesity. Given the important role of obesity in the aetiology of both polycystic ovary syndrome (PCOS) and type 2 diabetes mellitus, our aim was to establish whether FTO variants are also implicated in PCOS susceptibility.METHODS: We performed a genetic association study of FTO variant rs9939609 using case-control analyses, conducted in 463 PCOS patients (geometric mean BMI 27.5 kg/m(2)) and 1,336 female controls (geometric mean BMI 25.3 kg/m(2)) of UK British/Irish origin. We also sought evidence for associations between FTO variation and circulating testosterone levels in 324 UK PCOS patients and 1,000 women from the Northern Finland Birth Cohort of 1966. Outcome measures included FTO rs9939609 genotype frequencies by participant group and androgen measures (testosterone, free androgen index) by genotype.RESULTS: There was a significant association between FTO genotype and PCOS status in the UK case-control analysis, which was attenuated by adjustment for BMI (Cochran-Armitage test, odds ratio [per minor allele copy] 1.30 [95% CI 1.12, 1.51], p = 7.2 x 10(-4) [unadjusted], p = 2.9 x 10(-3) [adjusted]). This association was most evident in obese PCOS patients (PCOS patients below median BMI vs UK controls, p = 0.11; above median BMI vs controls, p = 2.9 x 10(-4)). No relationship between FTO genotype and androgen levels was seen.CONCLUSIONS/INTERPRETATION: We provide the first evidence that variants that predispose to common obesity also result in altered susceptibility to PCOS, confirming the mechanistic link between these conditions. The predominant effect of FTO variants on PCOS susceptibility is probably mediated through adiposity. PMID: 18478198 Funding information This work was supported by: Medical Research Council, United Kingdom Grant ID: G0000934 Wellcome Trust, United Kingdom Grant ID: 068545/Z/02 Wellcome Trust, United Kingdom Grant ID: GR069224MA Wellcome Trust, United Kingdom Grant ID: 090532 Medical Research Council, United Kingdom Grant ID: G9700120

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,470
Score d'incertitude au seuil0,756

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0080,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,4700,270

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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