Biogeography and systematics of Hildenbrandia (Rhodophyta, Hildenbrandiales) in Europe: inferences from morphometrics and rbcL and 18S rRNA gene sequence analyses
Notice bibliographique
Résumé
Twenty-one marine and freshwater specimens of Hildenbrandia from Europe were compared by analyses of morphometric data and sequences of the rbcL chloroplast gene (which codes for the large subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase enzyme) and the nuclear 18S ribosomal RNA (rRNA) gene. Eleven freshwater specimens, all corresponding to H. rivularis, were collected from the British Isles, Germany, France, Austria, Spain and Italy. Six marine specimens, representing H. rubra, were obtained from Northern Ireland, Wales, France, Norway, Sweden and the Netherlands, while four marine specimens, corresponding to H. crouanii, were collected from Scotland and Germany. Morphometric analyses of vegetative and reproductive characters distinguished three groups of specimens, which correspond to the three species. Parsimony and distance analyses of the rbcL and 18S rRNA genes were performed on these samples and sequences of North American representatives were included to determine their inter-relationships. The rbcL gene sequence analyses separated the marine and freshwater specimens, with the H. rivularis and H. angolensis representatives forming a well- supported monophyletic clade. The rbcL sequence analyses did not resolve the groupings of marine specimens determined in the morphometric analysis. Analyses of the 18S rRNA gene sequences also supported separation of the marine samples from freshwater samples, although the bootstrap and decay support was not as strong as for the rbcL gene. H. rubra formed a monophyletic clade that was weakly supported. In terms of biogeographic trends, the fairly low intraspecific divergence of H. rivularis (0–1·9% for the rbcL gene and 0–3·6% for the 18S rRNA gene) and the positioning of these samples in the gene trees supports the concept that they are derived from marine populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».