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Enregistrement W4238940360 · doi:10.5539/jmbr.v8n1p130

Mir-186-5p Regulates WNT Signaling Pathway by Targeting TCF4 Transcription Factor

2018· article· en· W4238940360 sur OpenAlexvenueno aff
Zahra Bayat, Bahram M. Soltani

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWnt signaling pathwayTCF4BiologyCell cyclemicroRNASignal transductionCell biologyTranscription factorLRP6LRP5Cell cultureMolecular biologyCellCancer researchGeneGeneticsEnhancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The evolutionarily conserved Wnt signaling pathway plays essential roles during embryonic development, tissue homeostasis and differentiation. This pathway is deregulated in many cancers especially colorectal cancer. MiRNAs are a class of small noncoding RNAs that may play a major role in post transcriptional regulation of many genes and signaling pathway such as WNT signaling pathway. Here, we intended to investigate if miR-186-5p is capable of regulating WNT signaling pathway wia suppression TCF4 gene expression. miR-186-5p was bioinformatically predicted as a candidate regulator of TCF4 gene expression and then, in this experimental study, miR-186-5p was overexpressed in SW480 cell line and its increased expression was detected through quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR). The effect of miR-186-5p on WNT pathway was analysied with TOP/FOP flash assay in SW480 cell line. Finally, flow cytometery was used to inves tigate the effect of miR-186-5p overexpression on cell cycle progression in SW480 cell line. miR-186-5p was overexpressed in the SW480 cell line and its overexpression resulted in significant reduction of the TCF4 mRNA level. TOP/FOP flash assay, confirmed the negative effect of miR-186-5p on the Wnt pathway in SW480 cells. Finally, Overexpression of miR186-5p in SW480 cells resulted in cell cycle arrest in subG1 phase, detected by flow cytometry. Overall, accumulative results indi-cated that miR-186-5p by targeting TCF4 is potentially one of the regulators of the WNT signaling pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,721

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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