P.057 Next-generation sequencing to determine a genetic cause of familial intracranial aneurysms
Notice bibliographique
Résumé
Background: Approximately 12-15% of patients with intracranial aneurysms (IA) have affected first-degree relatives, and are considered to have familial intracranial aneurysms (FIA). Individuals with FIA are at higher risk for aneurysm formation and subarachnoid hemorrhage. THSD1 is the only gene to be associated with nonsyndromic FIA at this time. Our study aims to find rare DNA variants that are major risk factors for FIA in our cohort of patients. Methods: To date we have enrolled 37 affected and 31 unaffected people from 16 families. We have done exome or genome sequencing on at least 1 person from each of 12 families. Results: A rare p.(R686W) variant in THSD1 was found in 1/12 families, but did not cosegregate fully with disease. While less attractive as the primary cause of FIA, we cannot rule out the potential modifying effects of THSD1 p.(R686W) in this family. A second candidate, an extracellular matrix gene within a chromosomal region previously implicated by familial mapping studies, contains rare variants in 4/12 of our families. All four variants are predicted to be damaging. Conclusions: Alongside environmental risk factors, individual FIA families may also have complex rare variant contributions to their disease, such as digenic and multi-locus contributions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».