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Enregistrement W4238979360 · doi:10.2174/0929867311320020008

A Metabolomic Study Reveals Novel Plasma Lyso-Gb3 Analogs As Fabry Disease Biomarkers

2012· article· en· W4238979360 sur OpenAlexaff
F.O. Dupont, R. Gagnon, Michel Boutin, Christiane Auray‐Blais

Notice bibliographique

RevueCurrent Medicinal Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFabry diseaseGlobotriaosylceramideSphingolipidMetabolomicsAlpha-galactosidaseChemistryInternal medicineBiomarkerEndocrinologyDiseaseMedicineBiochemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fabry disease is an X-linked, multisystemic lysosomal storage disorder due to alpha-galactosidase A deficiency. It is characterized by the accumulation of glycosphingolipids, mainly globotriaosylceramide (Gb3), in biological fluids, vascular endothelium, heart, and kidneys. Treatment by enzyme replacement therapy has been shown to be beneficial in both males and females affected with the disease. In addition to Gb3, increased concentrations of globotriaosylsphingosine (lyso-Gb3) have recently been reported in urine and plasma of Fabry patients. The overall objective of this metabolomic study was to identify and characterize new potential plasma biomarkers in treated and untreated males and females affected with Fabry disease which might better reflect disease severity and progression. We employed a time-of-flight mass spectrometry metabolomic approach using plasma samples of Fabry patients compared to age-matched controls. We found three new lyso-Gb3 analogs in Fabry patients presenting m/z ratios at 802, 804, and 820. As previously detected by our group, we also found a m/z ratio of 784 corresponding to the lyso-Gb3 molecule minus two hydrogen atoms. Using exact mass measurements and tandem mass spectrometry, we confirmed that these analogs result from modifications of the lyso-Gb3 sphingosine moiety. We evaluated the relative plasma concentration by measuring area counts for each lyso-Gb3 analog. None of these analogs was detected in the majority of healthy controls. The relative concentration of each analog was higher in males compared to female Fabry patients. We demonstrated that mass spectrometry combined to a metabolomic approach is a powerful tool to detect and identify new potential biomarkers. Keywords: Biomarkers, Fabry disease, globotriaosylsphingosine (Lyso-Gb3), metabolomics, OPLS-DA, plasma, Qtof mass spectrometry, multisystemic lysosomal, alpha-galact, glycosphingolipids

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,576
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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