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Enregistrement W4239163968 · doi:10.1577/t05-149.1

Pacific Rim Population Structure of Sockeye Salmon as Determined from Microsatellite Analysis

2005· article· en· W4239163968 sur OpenAlexaff
Terry D. Beacham, Brenda McIntosh, Cathy MacConnachie, Kristina M. Miller, Ruth E. Withler, Natalia Varnavskaya

Notice bibliographique

RevueTransactions of the American Fisheries Society · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesAlaska Department of Fish and GameU.S. Fish and Wildlife ServiceDental Foundation of Oregon
Mots-clésOncorhynchusBayPopulationGeographyFisheryMicrosatelliteBiologyEcologyFish <Actinopterygii>AlleleArchaeologyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Pacific Rim population structure of sockeye salmon Oncorhynchus nerka was examined with a survey of microsatellite variation. Variation at 14 microsatellite loci was surveyed for over 48,000 sockeye salmon sampled from 299 localities ranging from the Columbia River to Japan. The value of the genetic differentiation index F ST over all populations and loci was 0.097; individual locus values ranged from 0.038 to 0.154. Sockeye salmon from the Queen Charlotte Islands and the Columbia River displayed the least number of alleles relative to sockeye salmon from other regions in the Pacific Rim distribution of the species. Conversely, sockeye salmon displaying the greatest allelic diversity were observed in Southeast Alaska and the central coast of British Columbia. Sockeye salmon from these two regions displayed approximately 30% more alleles than did sockeye salmon from the Queen Charlotte Islands and the Columbia River. Sockeye salmon from Russia and western Alaska were, on average, less diverse than sockeye salmon from Southeast Alaska and more southerly locations in North America. A regional structuring of populations was generally observed among the sockeye salmon populations sampled, and populations were clustered within lakes and river drainages. At the Pacific Rim scale of population structure, there were two major groups of populations. The first group included populations from Russia, Bristol Bay, Kodiak Island, the Alsek River, and the Queen Charlotte Islands. The second group generally included populations from Southeast Alaska, British Columbia, and Washington. The distribution of microsatellite variation of sockeye salmon on a Pacific Rim basis reflected the origins of sockeye salmon radiating from refuges after the last glaciation period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,409

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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