Identification of PEX5p-related novel peroxisome-targeting signal 1 (PTS1)-binding proteins in mammals
Notice bibliographique
Résumé
Based on peroxin protein 5 (Pex5p) homology searches in the expressed sequence tag database and sequencing of large full-length cDNA inserts, three novel and related human cDNAs were identified. The brain-derived cDNAs coded for two related proteins that differ only slightly at their N-terminus, and exhibit 39.8% identity to human PEX5p. The shorter liver-derived cDNA coded for the C-terminal tetratricopeptide repeat-containing domain of the brain cDNA-encoded proteins. Since these three proteins specifically bind to various C-terminal peroxisome-targeting signals in a manner indistinguishable from Pex5p and effectively compete with Pex5p in an in vitro peroxisome-targeting signal 1 (PTS1)-binding assay, we refer to them as ‘Pex5p-related proteins’ (Pex5Rp). In contrast to Pex5p, however, human PEX5Rp did not bind to Pex14p or to the RING finger motif of Pex12p, and could not restore PTS1 protein import in Pex5−/− mouse fibroblasts. Immunofluorescence analysis of epitope-tagged PEX5Rp in Chinese hamster ovary cells suggested an exclusively cytosolic localization. Northern-blot analysis showed that the PEX5R gene, which is localized to chromosome 3q26.2–3q27, is expressed preferentially in brain. Mouse PEX5Rp was also delineated. In addition, experimental evidence established that the closest-related yeast homologue, YMR018wp, did not bind PTS1. Based on its subcellular localization and binding properties, Pex5Rp may function as a regulator in an early step of the PTS1 protein import process.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».