Understanding and exploiting the response of EHEC O157:H7 to human gastrointestinal chemical signals
Notice bibliographique
Résumé
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) is a clinically relevant foodborne pathogen, resulting in over 95,000 cases of EHEC-associated illness and 60 deaths each year in the US alone. Since EHEC is a continuous global issue with new outbreaks constantly occurring, the development of new therapeutic strategies is vital to minimizing the cases of infection seen each year. A key aspect in new drug development is the identification of vulnerabilities in EHEC’s pathogenicity, in particular, during its transit through the human gastrointestinal (GI) tract. As EHEC passes through the human GI tract to its site of colonization in the large intestine, it faces a multitude of host assaults including acute acid stress in the stomach, bile salt stress and cationic antimicrobial peptide exposure in the small intestine, and short chain fatty acid (SCFA) stress in the large intestine. The research carried out in this doctoral dissertation focuses on understanding how EHEC senses chemical cues from the host’s innate immune responses and how this knowledge can be exploited to develop effective antimicrobial strategies. Our findings successfully demonstrate that a novel antimicrobial peptide ameliorates infection in a mouse model of infection by enhancing acid-induced pathogen killing during gastric passage, and that the DNAbinding protein, Dps, plays a significant role in protecting EHEC against peptide killing. Moreover, this research successfully shows that varying concentrations of SCFAs result in differential modulation of EHEC virulence – a finding that contributes to our understanding of the role of diet and commensal flora in host susceptibility to infection. Together the findings of this research demonstrate how the selected innate host defences throughout the human GI tract can be exploited and/or manipulated to effectively prevent infection by the human pathogen EHEC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».