Structural and functional differences of two toxins from the scorpion Pandinus imperator K.C. Klenk and T.C. Tenenholz contributed equally to this study. Atomic Coordinates of the 18 acceptable structures and the NMR-derived restraints used to generate them have been deposited with the Protein Data Bank (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, New Brunswick, NJ), under the file name: 1C49 (PDB ID).The Supplementary Material referred to in this article can be found at http://www.interscience.wiley.com/jpages/0887-3585/suppmat/index.html.
Notice bibliographique
Résumé
The Pandinotoxins, PiTX-Kα and PiTX-Kβ, are members of the Charybdotoxin family of scorpion toxins that can be used to characterize K+ channels. PiTX-Kα differs from PiTX-Kβ, another peptide from Pandinus imperator, by one residue (P10E). When the two toxins are compared in a physiological assay, the affinity of PiTX-Kβ for voltage-gated, rapidly inactivating K+ channels in dorsal root ganglia (DRG) neurons is 800-fold lower than that of PiTX-Kα (Kα-IC50 = 8.0 nM versus Kβ-IC50 = 6,500 nM). To understand this difference, the three-dimensional structure of PiTX-Kβ was determined by nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and compared to that of PiTX-Kα. This comparison shows that structural differences between the two toxins occur at a residue that is critical for blocking K+ channels (K27) as well as at the site of the natural mutation (P10E). In PiTX-Kβ, the negatively charged carboxylate oxygen of E10 can approach the positive charge of K27 and presumably reduces the net positive charge in this region of the toxin. This is likely the reason why PiTX-Kβ binds K+ channels from DRG neurons with a much lower affinity than does PiTX-Kα. Proteins 2000;38:441–449. © 2000 Wiley-Liss, Inc.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».