USCAP 2018 Abstracts: Gynecologic and Obstetric Pathology (1127–1316)
Notice bibliographique
Résumé
Background: While uterine serous carcinomas (USCs) are morphologically and immunophenotypically indistinguishable from their ovarian counterparts, questions remain on whether these tumors share similar molecular profile and therefore could benefit from similar therapies.Somatic and germline defects in genes of the homologous recombinant(HR) pathway(BRCA1, BRCA2 and others) have been implicated in ovarian cancer predisposition and are associated with high sensitivity to platinum-based and targeted therapies(PARP inhibitors).HR deficiency impairs normal DNA repair resulting in loss or duplication of chromosomal regions, termed genomic loss of heterozygosity(LOH).Whether this phenomenon applies to USCs is yet to be determined.In this study, we analyzed genome-wide LOH in USCs and correlated its extent with clinicopathological parameters and survival outcomes.Design: 69 platinum treated USC patients diagnosed between 1998-2015 were included.DNA was isolated from FFPE and LOH analysis was performed querying over 220,000 SNPS using the Affymetrix OncoScan.Selecting the top quartile of LOH distribution as a cut point to separate patients into LOH "high" and LOH "low" groups, data was analyzed using KM survival analyses.Results: Patients' ages ranged from 45 -89(median 68) yrs.Stage distribution included: 11.5% I, 1.5% II, 62% III and 25% IV.Lymphadenectomy was performed in 74% and omentectomy in 62% of patients.80% of patients received adjuvant radiotherapy.Median LOH was 1.4% (range 0-30.1%) and the top quartile threshold was 9.9%.52 tumors showed LOH lower than the top quartile.In the top quartile of LOH, tumors were more common in African Americans(83% vs 56%), advanced stage(100% vs 82%) and more commonly associated with outer half MI(76.5% vs 47%) and LVI(88% vs 65%) when compared to tumors with LOH lower than the top quartile.In general, LOH did not significantly correlate with age(p=0.41),race(p=0.43),tumor size(p=0.72),stage(p=0.36),MI(p=0.52),LVI(p=0.40),LN metastases(p=0.43),or recurrence(p=0.34).KM analysis showed no survival benefit nor prolonged DFI for platinum treated patients with LOH in the top quartile compared to LOH lower than that. Conclusions:In our cohort of USCs, median LOH was 1.4%, with 25% of tumors showing genomic LOH higher than 9.9%.In contrast to their ovarian counterparts, a high degree of genomic LOH does not correlate with survival benefit for platinum treated USC patients, suggesting that these tumors may have distinct biology and genomic profile.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,478 | 0,246 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».