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Enregistrement W4239799318 · doi:10.7554/elife.09419.019

Decision letter: The chemokine CXCL13 in lung cancers associated with environmental polycyclic aromatic hydrocarbons pollution

2015· peer-review· en· W4239799318 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemokine receptors and signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLung cancerCarcinogenCXCR5LungSmokeCarcinogenesisCancer researchMedicineCancerChemokineChemistryEnvironmental healthPathologyImmunologyInternal medicineChemokine receptorInflammationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung cancer causes the most cancer deaths worldwide. For decades, people have known that lung cancer is associated with environmental factors, and both cigarette smoke and air pollution are known to cause cancers in humans. Smoke and air pollution both contain chemicals called polycyclic aromatic hydrocarbons (or PAHs). These chemicals cause chronic inflammation of the lung, which in turn is a major risk factor for developing lung cancer. However, it is unclear exactly how PAHs trigger inflammation and cancer. Xuanwei City in China is suited to the study of this question because until the 1970s its inhabitants used 'smoky coal' for cooking in unventilated indoor spaces; this produced high levels of small particles that contain high concentrations of PAHs. Women from this region, who traditionally do most of the cooking, have rates of lung cancer comparable to those of men. In other parts of China a woman’s chance of getting lung cancer is approximately half that of a man’s. Therefore, Xuanwei City provides a setting in which air pollution is a main contributor to lung cancer risk. Wang, Cheng et al. have now compared the levels of certain proteins (which are linked to inflammation) in lung cancer patients from Xuanwei City with those in control regions of China. The level of one such protein marker, called CXCL13, was particularly high in almost all patients from Xuanwei City, but only highly expressed in half of the patients from the control regions. Moreover, there was also a clear link between cigarette smoke and CXCL13 expression because, in control regions, smokers were much more likely to have high levels of CXCL13 than non-smokers. To test whether PAHs cause CXCL13 expression, Wang, Cheng et al. first exposed normal lung epithelial cells, cancer cells and then mice to a PAH. These experiments showed that CXCL13 levels did indeed increase and the mice developed lung tumours. However, when the genes for CXCL13 or its binding partner were deleted, the mice no longer got cancer when exposed to the PAH. This shows that CXCL13 signalling is an important mechanism by which PAHs cause lung cancer. Lastly, further experiments showed that CXCL13’s binding partner is highly expressed on some immune cells that can promote lung cancer. Importantly, the over-expression of CXCL13 occurred before the lung tumours developed. This might provide a new treatment strategy in which CXCL13 signalling could be inhibited after the exposure to PAHs. Future studies may now focus on discovering new drugs, or modifying existing drugs, to achieve this goal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0110,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0940,045

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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