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Enregistrement W4239865308 · doi:10.1093/jxb/erx005

A portrait of the C<sub>4</sub>photosynthetic family on the 50th anniversary of its discovery: species number, evolutionary lineages, and Hall of Fame

2017· review· en· W4239865308 sur OpenAlexaff
Rowan F. Sage

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPortraitPhotosynthesisBiologyBotanyEvolutionary biologyArtArt history

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fifty years ago, the C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; photosynthetic pathway was first characterized. In the subsequent five decades, much has been learned about C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; plants, such that it is now possible to place nearly all C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; species into their respective evolutionary lineages. Sixty-one independent lineages of C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; photosynthesis are identified, with additional, ancillary C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; origins possible in 12 of these principal lineages. The lineages produced ~8100 C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; species (5044 grasses, 1322 sedges, and 1777 eudicots). Using midpoints of stem and crown node dates in their respective phylogenies, the oldest and most speciose C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; lineage is the grass lineage Chloridoideae, estimated to be near 30 million years old. Most C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; lineages are estimated to be younger than 15 million years. Older C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; lineages tend to be more speciose, while those younger than 7 million years have &lt;43 species each. To further highlight C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; photosynthesis for a 50th anniversary snapshot, a Hall of Fame comprised of the 40 most significant C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; species is presented. Over the next 50 years, preservation of the Earth’s C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; diversity is a concern, largely because of habitat loss due to elevated CO&lt;SUB&gt;2&lt;/SUB&gt; effects, invasive species, and expanded agricultural activities. Ironically, some members of the C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; Hall of Fame are leading threats to the natural C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; flora due to their association with human activities on landscapes where most C&lt;SUB&gt;4&lt;/SUB&gt; plants occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,263
Score d'incertitude au seuil0,747

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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