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Enregistrement W4239865308 · doi:10.1093/jxb/erx005

A portrait of the C<sub>4</sub>photosynthetic family on the 50th anniversary of its discovery: species number, evolutionary lineages, and Hall of Fame

2017· review· en· W4239865308 sur OpenAlexaff
Rowan F. Sage

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Botany · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPortraitPhotosynthesisBiologyBotanyEvolutionary biologyArtArt history

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fifty years ago, the C 4 photosynthetic pathway was first characterized.In the subsequent five decades, much has been learned about C 4 plants, such that it is now possible to place nearly all C 4 species into their respective evolutionary lineages.Sixty-one independent lineages of C 4 photosynthesis are identified, with additional, ancillary C 4 origins possible in 12 of these principal lineages.The lineages produced ~8100 C 4 species (5044 grasses, 1322 sedges, and 1777 eudicots).Using midpoints of stem and crown node dates in their respective phylogenies, the oldest and most speciose C 4 lineage is the grass lineage Chloridoideae, estimated to be near 30 million years old.Most C 4 lineages are estimated to be younger than 15 million years.Older C 4 lineages tend to be more speciose, while those younger than 7 million years have <43 species each.To further highlight C 4 photosynthesis for a 50th anniversary snapshot, a Hall of Fame comprised of the 40 most significant C 4 species is presented.Over the next 50 years, preservation of the Earth's C 4 diversity is a concern, largely because of habitat loss due to elevated CO 2 effects, invasive species, and expanded agricultural activities.Ironically, some members of the C 4 Hall of Fame are leading threats to the natural C 4 flora due to their association with human activities on landscapes where most C 4 plants occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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