Chemical genomics and molecular medicine
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is the etiologic agent of tuberculosis and infects *32% of the human population.The cell envelope of mycobacteria is endowed with a number of unique lipids that play an important role in its virulence.Large multifunctional proteins called polyketide synthases (PKSs) catalyze the biosynthesis of these lipids.PKSs are generally involved in the synthesis of secondary metabolites in various organisms and their role in biosynthesis of virulence factors is unprecedented.PKSs require proteins called fatty acyl AMP ligases for the activation and utilization of fatty acid substrates.PKS12 is the largest open reading frame in the Mtb genome and contains at least twelve different catalytic sites on a single protein.Our systematic investigation of PKS12 protein revealed formation of a novel supramolecular assembly that catalyzes biosynthesis of a mycobacterial phospholipid antigen.Clearly, the lipid repertoire of mycobacteria necessitates a coordinated network of various biosynthetic enzymes.Insights into these molecular events provide an opportunity to develop inhibitors that would simultaneously disrupt several pathways in lipid metabolism.Due to overlapping substrate specificities and cofactor requirements of various enzymes involved in lipid biosynthesis, directed synthesis of chemical compounds targeting multiple pathways could provide new avenues for drug discovery.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,025 | 0,016 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».