Biobanking Framework: “One Size Fits All”
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Biobanking has been identified as a key area for development in order to accelerate the discovery and development of new drugs. biobanks include not only a collection of specimens but associated -omics data, thus the need for databases that inventory samples, associated clinical and omics data. As access to human biospecimens is becoming less of a barrier to translational studies, it is becoming clear that annotation of human samples and complex databases is our next hurdle. Purpose In this paper, we elaborate on the steps and processes that were considered in order to establish the Research Institute of the McGill University Health Center Liver Disease Biobank (RIMUHC-LDB) and highlight the success of our translational projects that sustain this biobank. Results The workflow model is based on a two-tier approach: a “mother” protocol that requires participant’ signed consent form and a “companion” protocol which allows the use of biospecimens and data for research. The “companion” protocol is based on a review of the protocol by the biospecimen access committee (BAC) and approval followed by an expedited review by the research ethics board. Our workflow is open, in addition, to include different prearranged requirements for collection of biospecimen and data from different project. Following strict standard operating procedures and ensuring that biospecimens are processed in a short amount of time after procurement, we are able to provide high quality biospecimen and data. Also, integrated in our biospecimen procurement process is our Quality Assurance Program (QAP). Every 4 months two samples are randomly selected and screened. We regularly isolate RNA from these tissue samples, labeled Quality Assurance/ Quality Control (QA/QC), and assess their RNA integrity number (RIN). Conclusions The biobank has enabled national and international access of biospecimen and data for genomic, proteomic and phenotypic research in addition to provide the biobank financial sustainability. Understanding the complexity of disease has and will always remain a challenge. As disease burden has shifted from acute conditions to chronic conditions, primarily seen in community and primary care (PC) rather than tertiary care centers, new approaches for forging relationships with local and regional community partners will become increasingly critical. A personalised PC Biobank along with disease-specific biobanks and industry biobanks (clinical trials) will ensure that the best personalised care is delivered to participants.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,163 | 0,155 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,007 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,015 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,033 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».