<i>Tubeufia asiana</i>, the teleomorph of<i>Aquaphila albicans</i>in the Tubeufiaceae, Pleosporales, based on cultural and molecular data
Notice bibliographique
Résumé
The teleomorph of Aquaphila albicans was discovered on submerged wood collected in Thailand. Its black, soft-textured, setose ascomata, bitunicate asci and hyaline to pale brown, multiseptate ascospores indicated an affinity to Tubeufiaceae (Dothideomycetes). After morphological or molecular comparisons with related species in Tubeufia, Acanthostigma and Taphrophila, it is described and illustrated as a new species, T. asiana Sivichai & K.M. Tsui, sp. nov. Finding this Tubeufia teleomorph was surprising, given the falcate conidia of its A. albicans anamorph, which superficially resemble the conidia of Fusarium and not the coiled, helicosporous conidia of other species in Tubeufiaceae. We assessed the phylogenetic relationships of A. albicans-T. asiana with ribosomal sequences from SSU and ITS and partial LSU regions by parsimony and Bayesian analysis. An initial set of 40 taxa representing a wide range of ascomycete families and their SSU sequences from GenBank showed A. albicans-T. asiana to be nested within the Tubeufiaceae with 100% bootstrap support. Their placement was inferred with ITS and partial LSU ribosomal sequences. The nearly identical ITS sequences of two isolates of A. albicans and one isolate of Tubeufia asiana united these fungi as a monophyletic group with 100% bootstrap support and further nested them, with 88% bootstrap support, in a clade containing Helicoon gigantisporum and Helicoma chlamydosporum. This is the first molecular phylogenetic study to place a nonhelicosporous species within the Tubeufiaceae and to show that helical conidia were lost at least once within the family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».