Using environmental DNA to monitor the reintroduction success of the Rhine sculpin ( <i>Cottus rhenanus</i> ) in a restored stream
Notice bibliographique
Résumé
As a consequence of the strong human impact on freshwater ecosystems, restoration measures are increasingly applied to restore and maintain their good ecological status. The ecological status of freshwaters can be inferred by assessing the presence of indicator species, such as the Rhine sculpin ( Cottus rhenanus ). However, traditional methods of monitoring fish, such as electrofishing, are often challenging and invasive. To augment or even replace the traditional fish monitoring approach, the analysis of environmental DNA (eDNA) has recently been proposed as an alternative, sensitive approach. The present study employed this modern approach to monitor the Rhine sculpin, a species that has been reintroduced into a recently restored stream within the Emscher catchment in Germany, in order to validate the success of the restorations. We monitored the dispersal of the Rhine sculpin using replicated 12S end-point PCR eDNA surveillance at a fine spatial and temporal scale to investigate the applicability of analyzing eDNA for freshwater ecosystem monitoring. We also performed traditional electrofishing in one instance to compare visual and eDNA-based assessments. We could track the dispersal of the Rhine sculpin and showed a higher dispersal potential of the species than we assumed. Furthermore, the eDNA analysis showed higher sensitivity for detecting the species than traditional electrofishing, although false negative results occurred at early reintroduction stages. Our results show that analyzing eDNA is capable of validating and tracking ecological reintroductions and contribute to the assessment and modelling of ecological status of streams.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».