Peer Review #1 of "Identification and characterization of Gypsophila paniculata color morphs in Sleeping Bear Dunes National Lakeshore, MI, USA (v0.2)"
Notice bibliographique
Résumé
Background.Gypsophila paniculata (baby's breath) is an invasive species found throughout much of the northwest United States and western Canada.Recently, plants exhibiting a different color morphology were identified within the coastal dunes along eastern Lake Michigan.The common baby's breath (G.paniculata) typically produces stems that are purple in color (purple morph), while the atypical morph has stems that are green-yellow (green-yellow morph).The purpose of this study was to characterize these newly identified morphs and determine if they are genetically distinct species from the common baby's breath in order to assess whether alternative management strategies should be employed to control these populations.Methods.We sequenced two chloroplast regions, rbcL and matK, and one nuclear region, ITS2, from the purple morphs and green-yellow morphs collected from Sleeping Bear Dunes National Lakeshore, MI, USA (SBDNL).Sequences were aligned to reference sequences from other Gypsophila species obtained from the Barcode of Life (BOLD) and GenBank databases.We also collected seeds from wild purple morph and wild green-yellow morph plants in SBDNL.We grew the seeds in a common garden setting and characterized the proportion of green-yellow individuals produced from the two color morphs after five-months of growth.Results.Phylogenetic analyses based upon rbcL, matK, and ITS2 regions suggest that the two color morphs are not distinct species and they both belong to G. paniculata.Seeds collected from wild green-yellow morphs produced a significantly higher proportion of green-yellow individuals compared to the number produced by seeds collected from wild purple morphs.However, seeds collected from both color morphs produced more purple morphs than green-yellow morphs.Discussion.Based upon these results, we propose that the two color morphs are variants of G. paniculata.Given the significant difference in the number of green-yellow morphs produced from the seeds of each morph type, we also suggest that this color difference has some genetic basis.We propose that current management PeerJ reviewing
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,046 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,004 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,329 | 0,160 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».