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Enregistrement W4240589339 · doi:10.1210/en.141.4.1356

The Rabbit Sex Hormone-Binding Globulin Gene: Structural Organization and Characterization of Its 5'-Flanking Region

2000· article· en· W4240589339 sur OpenAlexafffund
Yanting Ip

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésBiologyPromoterSex hormone-binding globulinExonTATA boxMolecular biologyGeneTranscription factorGeneticsGene expressionEndocrinologyHormoneAndrogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sex hormone-binding globulin (SHBG) transports sex steroids in the blood. In humans and rabbits, the gene encoding SHBG (shbg) is expressed primarily in the liver and testis, whereas the testis is the major site of shbg expression in rodents postnatally. Sequence analysis has revealed that rabbit shbg (rbshbg) spans 2.5 kb and comprises eight exons with consensus splice sites at all exon-intron junctions. The major transcription start site of rbshbg is located 52 bp upstream from the translation initiation codon for the rabbit SHBG precursor. Unlike the situation in humans and rats, rbshbg transcripts contain no alternative exon 1 sequences in the liver or testis, and this suggests that the rbshbg 5′-flanking region plays an equally important role in controlling transcription of this gene in these tissues. Like the human and rat shbg promoter sequences, the rbshbg proximal promoter lacks a typical TATA box. It also contains several transcription factor-binding sites, but deoxyribonuclease I footprinting experiments indicated that the human and rabbit shbg proximal promoters interact quite differently with proteins extracted from rabbit liver nuclei. However, the predominant footprint on the rbshbg promoter is conserved at the same position within the human shbg (hshbg) promoter and includes consensus binding sites for the transcription factor nuclear factor-1. Transient transfection studies of the rbshbg 5′-flanking sequence (893 bp) revealed regions that actively enhance and repress its activity in human hepatoblastoma and mouse Sertoli cells, but not in Chinese hamster ovary cells. Like the rat shbg proximal promoter, the rbshbg 5′-flanking sequence lacks a region that corresponds to a cis-element, designated footprinted region 4 in the hshbg proximal promoter. Furthermore, the hshbg promoter footprinted region 3 sequence is poorly conserved in rbshbg, and when mutated to resemble the corresponding human sequence it increased the transcriptional activity of the rbshbg promoter by 7-fold in hepatoblastoma cells. Thus, the rabbit and hshbg promoters appear to be controlled by a different set of transcriptional regulators. Further comparisons of their functional activities may shed light on species-specific differences in the spatial and temporal expression of this gene, the products of which play important roles in regulating sex steroid access to target cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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