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Enregistrement W4240817502 · doi:10.3410/f.9201958.9794056

Faculty Opinions recommendation of Competition for XPO5 binding between Dicer mRNA, pre-miRNA and viral RNA regulates human Dicer levels.

2011· dataset· en· W4240817502 sur OpenAlexaff
Craig A. Smibert, John Laver

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2011
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la RechercheSidactionUppsala UniversitetFondation pour la Recherche MédicaleStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésDicermicroRNABiologyDroshaCell biologyRNA interferenceRNARibonuclease IIIMessenger RNAMolecular biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) are a class of small, noncoding RNAs that function by regulating gene expression post-transcriptionally.Alterations in miRNA expression can strongly influence cellular physiology.Here we demonstrated cross-regulation between two components of the RNA interference (RNAi) machinery in human cells.Inhibition of exportin-5, the karyopherin responsible for pre-miRNA export, downregulated expression of Dicer, the RNase III required for pre-miRNA maturation.This effect was post-transcriptional and resulted from an increased nuclear localization of Dicer mRNA.In vitro assays and cellular RNA immunoprecipitation experiments showed that exportin-5 interacted directly with Dicer mRNA.Titration of exportin-5 by overexpression of either pre-miRNA or the adenoviral VA1 RNA resulted in loss of Dicer mRNA-exportin-5 interaction and reduction of Dicer level.This saturation also occurred during adenoviral infection and enhanced viral replication.Our study reveals an important crossregulatory mechanism between pre-miRNA or viral small RNAs and Dicer through exportin-5.miRNAs are single-stranded RNA of 19-24 nucleotides that are predicted to regulate up to 30% of protein-encoding genes.miRNA have been implicated in a vast array of cellular processes including cell differentiation, proliferation and apoptosis 1 .miRNA repertoires are highly cell type specific and change markedly during development or upon cell activation 2 .Changes in miRNA expression profile have been linked to human pathologies such as cancer and neurodegenerative diseases 3 .In the nucleus, primary RNA polymerase II

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,457
Score d'incertitude au seuil0,774

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,4570,180

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,327 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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