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Enregistrement W4241316628 · doi:10.1002/9781118960608.gbm00946

<i>Delftia</i>

2015· other· en· W4241316628 sur OpenAlexaff
Lindsay I. Sly, Aimin Wen, Mark Fegan

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2015
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiochemistryBiologyFatty acidChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Delf'tia. M.L. fem. n. Delftia referring to the city of Delft, the site of isolation of the type species, and in recognition of the role of Delft research groups in the development of bacteriology. Cells are straight to slightly curved rods , 0.4–0.8 × 2.5–4.1 µm (occasionally up to 7 µm), occurring singly or in pairs . Motile by means of polar or bipolar tufts of one to five flagella . Do not produce endospores. Gram negative. Oxidase and catalase positive . No fluorescent pigment produced. Poly‐β‐hydroxybutyrate is accumulated. Aerobic , having a strictly respiratory type of metabolism with oxygen as the terminal electron acceptor. Nonfermentative. Reduce nitrate to nitrite. Do not denitrify. Chemoorganotrophic . Good growth occurs on media containing organic acids, amino acids, peptone, and carbohydrates. Utilize mannitol and fructose as the sole carbon source, but not glucose. No autotrophic growth with H 2 . Hydrolyze acetamide. No levan formation from sucrose. Arginine dihydrolase absent. Meta cleavage of protocatechuate. Lipase (Tween 80 hydrolysis) positive. Main polyamines are putrescine and 2‐hydroxyputrescine . The major quinone is ubiquinone Q‐8 ; minor quinones are Q‐7 and Q‐9. Major fatty acids are hexadecanoic acid (C 16:0 ), hexadecenoic acid (C 16:1 ), and octadecenoic acid (C 18:1 ). 3‐hydroxy fatty acids (C 10:0 3OH and C 8:0 3OH ) but not 2‐hydroxy fatty acids are present. DNA–rRNA hybridization and 16S rRNA sequence analysis places the genus in the family Comamonadaceae . Isolated from soil, sediment, activated sludge, crude oil, oil brine, water, and various clinical samples. The mol % G + C of the DNA is : 67–69. Type species : Delftia acidovorans (den Dooren de Jong 1926) Wen, Fegan, Hayward, Chakraborty and Sly 1999, 573 ( Pseudomonas acidovorans den Dooren de Jong 1926, 106; Comamonas acidovorans (den Dooren de Jong 1926) Tamaoka, Ha and Komagata 1987, 58.) Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Delftia is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Pseudomonadota / Betaproteobacteria / Burkholderiales / Comamonadaceae / Delftia The genus Delftia can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Comamonas (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Pseudomonadota / c__Gammaproteobacteria / o__Burkholderiales / f__Burkholderiaceae / g__Comamonas * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 **

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,719
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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