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Enregistrement W4241363511 · doi:10.21203/rs.3.rs-57689/v2

Fluid flow exposure promotes Epithelial-to-Mesenchymal Transition and adhesion of breast cancer cells to endothelial cells

2020· preprint· en· W4241363511 sur OpenAlexaff
Kenneth F. Fuh, Robert D. Shepherd, Jessica S. Withell, Brayden K. Kooistra, Kristina D. Rinker

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpithelial–mesenchymal transitionAdhesionBreast cancerCell biologyMesenchymal stem cellFlow (mathematics)Cancer researchChemistryFlow cytometryTransition (genetics)CancerBiologyMedicineMechanicsInternal medicineImmunologyBiochemistryPhysicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Mechanical interactions between tumor cells and microenvironments are frequent phenomena during breast cancer progression, however, it is not well understood how interactions in the magnitude of those encountered in the vascular microenvironment affect expression of genes related to Epithelial-to-Mesenchymal Transition (EMT) and adhesion to endothelial cells. EMT is associated with the progression of most carcinomas through induction of new transcriptional programs within affected epithelial cells, resulting in cells becoming more motile and adhesive to endothelial cells. Methods: MDA-MB-231, SK-BR-3, BT-474, and MCF-7 cells and normal Human Mammary Epithelial Cells (HMECs) were exposed to fluid flow in a parallel-plate bioreactor system. Changes in gene expression were quantified using microarrays and qPCR, gene-gene interactions were elucidated using network analysis, and key modified genes were examined in clinical datasets. Changes in protein expression of key EMT markers between chemically induced EMT and flow-exposed cells were compared in immunocytochemistry assays. Finally, the ability of flow-stimulated and unstimulated cancer cells to adhere to an endothelial monolayer was evaluated in flow and static adhesion experiments. Results: Fluid flow stimulation resulted in upregulation of EMT inducers and downregulation of repressors. Specifically, Vimentin and Snail were upregulated both at the gene and protein expression levels in flow stimulated HMECs, suggesting progression towards an EMT phenotype. Flow-induced overexpression of a panel of cell adhesion genes was also observed. Network analysis revealed genes involved in cell flow responses including FN1, PLAU, and ALCAM. When evaluated in clinical datasets, overexpression of FN1, PLAU, and ALCAM was observed in patients with most subtypes of breast cancer. We also observed increased adhesion of flow-stimulated breast cancer cells compared to unstimulated controls, suggesting an increased potential to form secondary tumors at metastatic sites. Conclusions: This study shows that fluid forces on the order of 1 Pa promote EMT and adhesion of breast cancer cells to an endothelial monolayer and identified biomarkers were distinctly expressed in patient populations. A better understanding of how biophysical forces such as shear stress affect cellular processes involved in metastatic progression of breast cancer is important for identifying new molecular markers for disease progression, and for predicting metastatic risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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