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Enregistrement W4241562959 · doi:10.32920/ryerson.14652867.v1

High frequency photoacoustic characterization of single cells

2021· preprint· en· W4241562959 sur OpenAlexafffund
Eric M. Strohm

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiquePhotoacoustic and Ultrasonic Imaging
Établissements canadiensMcMaster UniversityToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesTerry Fox FoundationOntario Institute for Cancer ResearchOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsU.S. Department of Defense
Mots-clésFinite element methodMaterials sciencePhotoacoustic effectTransducerPhotoacoustic imaging in biomedicinePhotoacoustic spectroscopyOpticsMolecular physicsAnalytical Chemistry (journal)AcousticsChemistryPhysicsChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This dissertation presents the first photoacoustic study of single cells using ultra-high frequencies (UHF, over 100 MHz). At these frequencies, unique features occur in the photoacoustic signal spectrum which depend on the cell size, morphology and structure. A finite element model (FEM) was developed to simulate the photoacoustic signals from ideal spherical droplets containing a perfluorocarbon liquid and optically absorbing nanoparticles. The model was applied to droplets in suspension and on a boundary to examine how the photoacoustic spectrum varies with droplet size and configuration, and compared to measurements using a 375 MHz transducer. Good agreement in the spectral features between the measured values and the FEM and analytical solution were observed. For the droplet on a boundary, additional spectral features were observed there were correctly predicted by the FEM, but not the analytical solution. The FEM could be applied to situations where the analytical model cannot be used, such as the asymmetric shape of red blood cells (RBCs). Measurements of single RBCs were then compared to the FEM. The frequency location of the spectral minima shifted to higher frequencies as the RBC rotated from a vertical to horizontal orientation. The spectral minima shifted to lower frequencies as the RBC swelled from the normal biconcave shape to a spherical morphology. Healthy RBCs were differentiated from spherocytes, echinocytes and swollen RBCs using changes in the photoacoustic spectrum (p<0.001). These results suggest that the photoacoustic spectrum can be used to classify RBCs according to their shape and pathology. Classification of cells using the photoacoustic spectral features was applied to measurements of blood cells and circulating tumor cells (CTCs) such as melanoma and acute myeloid leukemia (AML) cells. Measurements of 89 cells showed that variations in the spectrum and signal amplitude could be used to identify and differentiate melanoma and AML cells from RBCs, thus identifying foreign cells in the bloodstream. This dissertation investigates how UHF photoacoustics can be used to identify and classify cells and particles in a sample using their photoacoustic spectra, with the end goal of using these methods to identify cell pathology and detect CTCs clinically.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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