Phenotypic, Biochemical and Molecular Diversity of Phoma lingam Fungal Isolates Collected from Saskatchewan, Canada
Notice bibliographique
Résumé
The population of Phoma lingam associated with blackleg disease of canola (Brassica napus) is highly polymorphic, and infect various Brassicaceae species, including Thlaspi arvense (stinkweed). In order to determine the population composition and pathogenicity of P. lingam infecting T. arvense, 18 isolates recovered from T. arvense (designated 'Thl' isolates) from different crop fields of Saskatchewan were compared with an aggressive (IBCN 2) and eleven less/non-aggressive reference strains. No common morphological, biochemical and pathogenic characteristics were found between 'Thl' isolates and IBCN 2 strain. DNA fingerprinting and phylogenetic analysis of ITS-rRNA gene sequences revealed that the 'Thl' P. lingam population of Saskatchewan is highly heterogeneous and comprised of at least eight genotypes. Over 50 percentage of 'Thl' isolates clustered with different less/non aggressive reference strains belonging to L. biglobosa. Interestingly, a group of' Thl' isolates clustered with an aggressive reference strain, IBCN 2. Therefore, regular monitoring is required to determine if the 'Thl' P. lingam population of western Canadian provinces is migrating from non-aggressive toward aggressive state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».