CELL SYSTEMS BIOLOGY OF TRANSLATION FACTORS AND PROTEASOME-TARGETED PROTEIN COMPLEXES ASSOCIATED WITH AGC KINASE SCH9
Notice bibliographique
Résumé
Sch9 appears to be the Saccharomyces cerevisiae homolog of protein kinase B and S6 kinase and is involved in the control of numerous nutrient-sensitive processes, including regulation of cell size, cell cycle progression, and stress resistance. Sch9 has also been implicated in the regulation of replicative and chronological life span. The availability of data from global studies of protein-protein interactions now makes it possible to predict and validate functional connections between Sch9, its putative substrates, and other proteins. Sch9 appears to be involved in control of biosynthetic and catabolic pathways. Thus, the analysis of Sch9-associated proteins indicates that this kinase may be involved in regulation of protein synthesis. Sch9 forms a complex with, and, presumably, phosphorylates starvation- and stress-induced protein kinase GCN2, which, in turn, phosphorylates translation initiation factor eIF2alpha. Sch9 also interacts with translation factors Arc1, Pab1 and prion-like protein Sup35. Thus, Sch9 may be part of the mechanism that relays availability of nutrients to utilization of glucose and to the rates of protein synthesis. One of the interesting outcomes of the proteome-wide analysis of protein-protein interactions in yeast is the finding that Sch9 associates with Shp1, Cdc48, and Ufd1, which form a complex responsible for the recognition and targeting of ubiquitinated proteins to the proteasome for degradation. It is unknown and remains to be elucidated, whether mammalian homologues of Sch9 are also associated with the proteins involved in translation/protein synthesis and proteasomal degradation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».