Detection of adenoviruses and enteroviruses in tap water and river water by reverse transcription multiplex PCR
Notice bibliographique
Résumé
A reverse transcription (RT) multiplex polymerase chain reaction (PCR) assay was developed to simultaneously detect adenoviruses and enteroviruses, both of which have attracted much attention as molecular indices of viral pollution in environmental samples. The method involves a reverse transcription step, followed by a multiplex nested PCR in which the combination of primers amplifies cDNA from enteroviruses and adenoviruses. The sensitivity of this assay was found to be similar to that of each monoplex PCR or RT-PCR assay, and to be consistent regardless of relative concentrations of adenoviruses and enteroviruses. To assess suitability and environmental application of the RT multiplex PCR assay, a total of 12 river water samples and 4 tap water samples were analyzed by RT multiplex PCR, each monoplex PCR or RT-PCR, and cell culture assay on the Buffalo Green Monkey kidney cell line. The sensitivity of the RT multiplex PCR was also found to be similar to that of each monoplex PCR in environmental samples. This suggests the RT multiplex PCR assay could be applied to the routine monitoring of viral pollution in environ mental waters.Key words: adenoviruses, enteroviruses, multiplex PCR, tap water.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».