Faculty Opinions recommendation of Structural snapshots of the reaction coordinate for O-GlcNAc transferase.
Notice bibliographique
Résumé
Visualization of the reaction coordinate undertaken by glycosyltransferases has remained elusive, but is critical for understanding this important class of enzyme.Using substrates and substrate mimics, we describe structural snapshots of all species along the kinetic pathway for human O-GlcNAc transferase, an intracellular enzyme that catalyzes installation of a dynamic posttranslational modification.The structures reveal key features of the mechanism and show that substrate participation is important during catalysis.Glycosyltransferases are ubiquitous enzymes that play vital cellular roles in organisms found in all kingdoms of life.These enzymes catalyze transfer of a sugar from a donor, most commonly a nucleotide sugar, to a variety of acceptors including proteins 1 .One glycosyltransferase that has received considerable recent attention is human O-GlcNAc transferase (OGT) 2 , 3 .OGT transfers N-acetylglucosamine from the sugar donor UDP-GlcNAc onto specific serine or threonine residues of nucleocytoplasmic proteins with inversion of configuration at the anomeric center (Fig. 1a) 3 .This post-translational Users may view, print, copy, download and text and data-mine the content in such documents, for the purposes of academic research, subject always to the full Conditions of use: http://www.nature.com/
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,038 | 0,030 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».