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Enregistrement W4241826210 · doi:10.1155/2015/825732

Combining Strengths in the Struggle Against HIV: 24<sup>th</sup> Annual Canadian Conference on HIV/AIDS Research

2015· article· en· W4241826210 sur OpenAlexaffabout
From Nairobi, Kenya Boily-Larouche, Lajoie, Omollo, Cheruiyot, Njoki, Oyugi, Fowke, Ali Vyboh, Brassard, Pierre C. Bélanger, Maud Chomont, Nicolas Ancuta, Petronela Routy, Jean-Pierre Montreal, Feras Al-Ghazawi, Parmar, Elliott Faller, Scott Sugden, Hafsa Cherid, Juzer Kakal, El Salfiti, Paul Ottawa, Alejandro Gómez, Ouellet, Tremblay, Kelly B. Arnold, Burgener, Birse, Romas, Dunphy, Shahabi, Abou, Kwatampora, Nyanga, Kimani, Masson, Liebenberg, Karim, Passmore, Lauffenburger, H Jiang, �. �. Arnol'd, Новак, Westmacott, Ball

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Infectious Diseases and Medical Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensManitoba Beekeepers' Association
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCD8Cytotoxic T cellImmunologyBiologyHuman immunodeficiency virus (HIV)Immune systemVirologyGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACkGROUND: The C-type lectin CD161 is expressed by CD4+ and CD8+ T cells sharing conserved transcriptional and functional signature.CD4+ T cells with type-17 profiles derived from CD161+ precursors and CD161-expressing CD8+ T cells share the same differentiation profile and include the unique anti-bacterial CD161++ mucosal-associated invariant T cells (MAIT) expressing invariant TCR Vα7.2.During HIV infection, circulating cells harbouring the signature of CD161+ cells are impaired in blood and mucosal compartments.In the female genital tract (FGT), portal of entry for HIV infection, the pattern of CD161 expression on CD4+ and CD8+ subsets and how HIV infection impacts these compartments remain unknown.Here, we explore these questions by characterizing CD161-expressing cells in the FGT of chronically HIVinfected (n=16), HIV-negative newly practising sex work (n=36) and highly HIV-exposed seronegative (HESN) (n=33) female sex workers (FSW) from Nairobi, Kenya.RESULTS: When compared to blood, CD161+CD4+ T cells were enriched in the FGT of HIV-negatives.CD161+CD8+ T cells were also enriched in the FGT of new FSW but not in HESN.Circulating and cervical CD161-expressing cells harboured a more activated profile with tissue-homing properties (CD69, CCR5 and β7) on both CD4+ and CD8+ subsets.The CD161++ subsets included MAIT.Stimulated CD161++ and CD161+CD8+ cells expressed IL-22 at higher frequency than CD161-cells.Expression of IL-17A and IL-22 was enriched in FGT, but independently of CD161 expression in cervical CD4+ cells.CD161++CD8+ T cells were depleted in HIV-positives compared to new FSW in both blood and cervix, but depletion of CD161+CD8+ subset was only observed in cervix.CONCLUSION: Impairment of the IL-17A/IL-22-enriched CD161+ +CD8+ and CD161+ subsets was observed for the first time in the FGT of HIV-infected FSW.Also, the absence of cervical enrichment of CD161+CD8+ cells in HESN agrees with a protective reduction of cervical inflammation.In contrast to blood, CD161 expression did not efficiently describe type-17 CD4+ T cells in the FGT.The FGT unique environment may importantly impact T cells plasticity promoting Th17 differentiation independently of CD161 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,562
Score d'incertitude au seuil0,872

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0060,005
Communication savante0,0090,003
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0240,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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