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Enregistrement W4241854304 · doi:10.12974/2312-5411.2015.02.01.2

Expansion of Primary Human AML by Aryl Hydrocarbon Receptor Antagonism Minimally Affects Leukemic Transcriptional Profiles but Alters Cellular Metabolism

2015· article· en· W4241854304 sur OpenAlexaff
Fanny L. Casado, Kyle R. Salci, Zoya Shapovalova, Borhane Guezguez, Tony Collins, Mickie Bhatia

Notice bibliographique

RevueJournal of Hematology Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAryl hydrocarbon receptorWnt signaling pathwayMyeloid leukemiaDownregulation and upregulationHaematopoiesisLeukemiaCancer researchCell biologyEx vivoOxidative phosphorylationBiologyIn vivoChemistryStem cellSignal transductionBiochemistryImmunologyTranscription factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Small molecule-based antagonism of the aryl hydrocarbon receptor (AHR) by StemRegenin1 (SR1) promotes ex vivo expansion and maintenance of primary human hematopoietic stem cells (HSCs) as well as acute myeloid leukemia (AML) cells. However, basis and nature of SR1 induced expansion of human AML remains unknown. Here, global expression profiling on 7 clinically diverse human AML patient samples treated ex vivo with a synthesized analog of SR1 (aSR1) uncovered that only as few as 750 genes were differentially regulated. Uniquely, aSR1 treatment did not modulate self-renewal associated pathways including Hedgehog, Notch or Wnt across patient samples, but instead resulted in overall upregulation of the oxidative phosphorylation metabolic pathway. Higher oxygen consumption rates, along with increased sensitivity to the chemotherapeutic agent cytarabine (AraC) validated that aSR1-induced transcriptional profiles lead to functional enhancement of oxidative phosphorylation. Our study reveals that aSR1 induces minor alterations to the leukemic transcriptional profile leading to a shift in cellular metabolism. This finding should further instruct use of SR1-mediated expansion for mechanistic studies of leukemic self-renewal and the development of drug screening platforms using patient specific AML samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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