Expansion of Primary Human AML by Aryl Hydrocarbon Receptor Antagonism Minimally Affects Leukemic Transcriptional Profiles but Alters Cellular Metabolism
Notice bibliographique
Résumé
Small molecule-based antagonism of the aryl hydrocarbon receptor (AHR) by StemRegenin1 (SR1) promotes ex vivo expansion and maintenance of primary human hematopoietic stem cells (HSCs) as well as acute myeloid leukemia (AML) cells. However, basis and nature of SR1 induced expansion of human AML remains unknown. Here, global expression profiling on 7 clinically diverse human AML patient samples treated ex vivo with a synthesized analog of SR1 (aSR1) uncovered that only as few as 750 genes were differentially regulated. Uniquely, aSR1 treatment did not modulate self-renewal associated pathways including Hedgehog, Notch or Wnt across patient samples, but instead resulted in overall upregulation of the oxidative phosphorylation metabolic pathway. Higher oxygen consumption rates, along with increased sensitivity to the chemotherapeutic agent cytarabine (AraC) validated that aSR1-induced transcriptional profiles lead to functional enhancement of oxidative phosphorylation. Our study reveals that aSR1 induces minor alterations to the leukemic transcriptional profile leading to a shift in cellular metabolism. This finding should further instruct use of SR1-mediated expansion for mechanistic studies of leukemic self-renewal and the development of drug screening platforms using patient specific AML samples.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».