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Enregistrement W4241886954 · doi:10.3410/f.738779497.793583864

Faculty Opinions recommendation of The O-GlcNAc transferase OGT is a conserved and essential regulator of the cellular and organismal response to hypertonic stress.

2021· dataset· en· W4241886954 sur OpenAlexaff
Siegfried Hekimi, Noah Lilienfeldt

Notice bibliographique

RevueFaculty Opinions – Post-Publication Peer Review of the Biomedical Literature · 2021
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthHarvard UniversityUniversity of PittsburghUniversity of Pennsylvania
Mots-clésCaenorhabditis elegansRegulatorBiologyCell biologyIntracellularFunction (biology)PhenotypeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The conserved O-GlcNAc transferase OGT O-GlcNAcylates serine and threonine residues of intracellular proteins to regulate their function.OGT is required for viability in mammalian cells, but its specific roles in cellular physiology are poorly understood.Here we describe a conserved requirement for OGT in an essential aspect of cell physiology: the hypertonic stress response.Through a forward genetic screen in Caenorhabditis elegans, we discovered OGT is acutely required for osmoprotective protein expression and adaptation to hypertonic stress.Gene expression analysis shows that ogt-1 functions through a posttranscriptional mechanism.Human OGT partially rescues the C. elegans phenotypes, suggesting that the osmoregulatory functions of OGT are ancient.Intriguingly, expression of O-GlcNAcylation-deficient forms of human or worm OGT rescue the hypertonic stress response phenotype.However, expression of an OGT protein lacking the tetracopeptide repeat (TPR) domain does not rescue.Our findings are among the first to demonstrate a specific physiological role for OGT at the organismal level and demonstrate that OGT engages in important molecular functions outside of its well described roles in post-translational O-GlcNAcylation of intracellular proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,010
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1180,090

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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