MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4241982083 · doi:10.1111/j.1365-3083.2008.02084.x

Reply

2008· article· fr· W4241982083 sur OpenAlexaff
Bent Rubin

Notice bibliographique

RevueScandinavian Journal of Immunology · 2008
Typearticle
Languefr
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensRobarts Clinical Trials
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésT-cell receptorCD3Size-exclusion chromatographyChemistryMolecular biologyT cellMonoclonal antibodyAntigenBiologyBiochemistryAntibodyImmunologyEnzymeImmune systemCD8

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the Editor The letter to the Editor, and the data in J. Immunol. Meth. 2007; 324: 74–83 from W. Schamel et al. suggest that one reason for the difference in calculating molecular weight of the TCR/CD3 complex ∼220 kDa versus the experimentally estimated one, ∼450 kDa, may be due to additional detergent micelle in the native complex. Our results were obtained using 1% Brij 98 detergent solubilized TCR/CD3 molecules and gel-filtration on Superose 6 HR. We used this detergent because it can be used with similar results at 4 and 37 °C (more physiological conditions) (personal communication with Dr H.T. He, CIML, Marseille, France), see also [1]. We have no arguments for or against the idea that detergent might increase the apparent molecular weight of the TCR/CD3 complexes. However, according to previous work from Schamel et al. [2], antigen-activation of T cells should aggregate TCR/CD3 complexes on the T cells. The main purpose of our gel-filtration experiments in Rubin et al. [3] was to compare apparent molecular weights of TCR/CD3 complexes from naïve, activated or hybridoma T cells. Accordingly, we expected to find aggregated TCR/CD3 complexes from the Vβ8+, activated T cells in the void volume (analysed by anti-Vβ8 mAb ELISA), or at least some of them. But no difference in molecular weight distribution was found between TCR/CD3 complexes from naïve (Vβ12+), hybridoma (Vβ2+) or activated T cells (Vβ8+). Though we have no idea, why we find results different from the Schamel group (except differences in technology), it is very important to discuss these issues and to design experiments, which could distinguish between different hypotheses. We thank Wolfgang Schamel et al. for their scientific initiative and wish them good luck in finding the ‘truth’. We also hope that this discussion might challenge other scientists in the field of TCR/CD3 structure/function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,961
Score d'incertitude au seuil0,000

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0150,017
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,029

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScandinavian Journal of ImmunologyMême sujetT-cell and B-cell ImmunologyTravaux en français237 207