Histone methylation in the freeze-tolerant wood frog, Rana sylvatica
Notice bibliographique
Résumé
The wood frog, Rana sylvatica, has developed numerous adaptations to survive days with up to 65% of its body fluid frozen.One such adaptation is to reduce their metabolic rate, employing only those processes needed to survive until temperatures rise.The establishment of this hypometabolic state is mediated by transcriptional regulation that is elicited in part by histone methylation, however this has yet to be explored in the context of metabolic rate depression and freeze tolerance.This thesis provides the first characterization of histone methyltransferases (HMTs) and the histone and non-histone proteins they methylate in the wood frog.Transcriptionally permissive histone residues (H3K4me1 and H3K27me1) were found to decrease during freezing in skeletal muscle while those that silence transcription (H3K9me3 and H3K36me2) were maintained, whereas differential levels of histone residues were seen in liver.These findings suggest a novel role for HMTs in freeze tolerance.student I am today.I thank you for your mentorship, insights into the world of science, academia, and administration, and truly value your advice inside and out of the lab.I would also like to thank Jan Storey for her editorial review of this thesis and other documents.It is your hard work, knowledge, and patience, that ensures the lab runs as smooth and successful as it does.I also thank all the Storey lab members, both past and present, for creating such a positive and fun environment to work in every day.In particular I would like to thank Sanoji Wijenayake for mentoring me and guiding my project, Kama Szereszewski for introducing me to the world of western blotting, and Bryan Luu for teaching me necessary techniques for other and future projects.Of course, I would not be here today if it were not for my parents, brother, and sister.Mom and Dad, thank you for always supporting, encouraging
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».