In this issue: Biotechnology Journal 5/2009
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In silico filtration scale‐up Francis and Haynes, Biotechnol. J. 2009, 5, 674–683 Controlled shear affinity filtration (CSAF) is an integrated bioprocess that positions a contoured rotor above a membrane affinity chromatography column to purify a secreted protein product directly from cell culture, e.g. monoclonal antibodies. However, for industrial application an effective method for scale‐up is needed. To achieve this Francis and Haynes from Vancouver (Canada) used computational fluid dynamics (CFD) simulations to determine fluid hydrodynamics and expected filter performance for CSAF units with increasing size. This resulted in an in silico design of a preparative CSAF device, which allows processing of 1000 L cell culture in two hours. In addition, the authors report a method for the parallelization of CSAF units that can be applied to volumes exceeding 1000 L. Substrate absorption in gas/solid biocatalysis Dimoulal, et al., Biotechnol. J. 2009, 5, 712–721 Gas/solid biocatalysis has various potential applications, including fine chemical synthesis and toxic pollutant degradation. To gain a deeper insight into the enzyme microenvironment of a gas/solid system, researchers from Aachen and Jülich (Germany) studied the adsorption of water and substrates to dry deposited alcohol dehydrogenase from Lactobacillus brevis. To monitor the system the well‐characterized conversion of acetophenone catalyzed by alcohol dehydrogenase was chosen. While acetophenone is adsorbed to the deposited enzyme preparation at a significant level, comparable to the amount of adsorbed water, 2‐propanol was not adsorbed at a detectable level. Reaction kinetics will to be studied in the future. Inclusion bodies resolved Dürauer, et al., Biotechnol. J. 2009, 5, 722–729 Recombinant proteins produced in Escherichia coli are often deposited in so‐called inclusion bodies (IBs). The purification of proteins in IBs requires several steps, including solubilization and refolding of non‐native proteins. Researchers from Vienna (Austria) report a new method for high‐throughput screening of solubilization conditions and evaluation of dissolution kinetics carried out in conventional 96‐well plates. This involves simple measurements of absorbance at 600 nm and 280 nm to determine turbidity and protein concentration. This new method will contribute to a faster development in the early stage of recombinant protein recovery from E. coli.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,346 | 0,230 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».