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Enregistrement W4242653428 · doi:10.1158/1538-7445.am2019-4457

Abstract 4457: Open science medicinal chemistry: Towards a treatment for DIPG

2019· article· en· W4242653428 sur OpenAlexaff
Sue Cramp, Nicole Hamblin, Jeff A. O’Meara, A.M. Edwards, O. C. Roberts, Alex N. Bullock, Paul Brennan

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging and Pathology Studies
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug discoveryDiseaseMedicineComputational biologyBioinformaticsBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Meds4Kids Pharma (M4K)1 is pioneering an open science approach to drug discovery, focussed on the discovery and development of small molecule therapeutics for orphan paediatric cancers. M4K seeks to test the hypothesis that an open science framework can be successfully applied not only to accelerate basic science, using the collective knowledge of the scientific community at large, but also to take an innovative new drug candidate all the way from discovery and clinical proof-of-concept through to product registration, by making use of regulatory data protections and market incentives. Since late 2017, Charles River Early Discovery has been providing in kind drug discovery services to help progress these efforts, including medicinal and synthetic chemistry. The first M4K project aims to generate an orally-available, brain-penetrant therapeutic to treat the diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG). DIPG is a rare, aggressive and uniformly fatal childhood brain cancer with a median survival time of 9-12 months and for which there are currently no effective drug treatments. The disease has been shown to be associated with mutations in the ACVR1 gene (activin A receptor, type 1) also known as ALK2 kinase. Early support for the therapeutic hypothesis that an inhibitor of ALK2 kinase would have clinical benefit in DIPG, came from in vivo studies with non-selective ALK2 kinase inhibitors, which both killed DIPG cell lines harbouring the ALK2 mutation and extended lifespan in xenograft mouse models.2 Working collaboratively with M4K and their open science partners, we have made excellent progress towards the identification of potent, selective, brain penetrant ALK2 inhibitors starting from the known inhibitor LDN-214117, previously described for FOP (fibrodysplasia ossificans progressiva).3 Our current lead compound has an excellent in vitro and in vivo profile showing high oral bioavailability and brain penetration in a mouse PK study and is progressing to proof of concept studies. In addition we are progressing with the identification of a back-up series. References: 1. https://m4kpharma.com/ 2. Carvalho et. al. Neuro-Oncology, Volume 18, Issue suppl_6, 1 November 2016, Pages vi154, https://doi.org/10.1093/neuonc/now212.639 3. Mohedas et. al., J. Med Chem, 2014, 57 (19), 7900 Citation Format: Sue Cramp, Nicole Hamblin, Jeff O'Meara, Aled Edwards, Owen Roberts, Alex Bullock, Paul Brennan. Open science medicinal chemistry: Towards a treatment for DIPG [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2019; 2019 Mar 29-Apr 3; Atlanta, GA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2019;79(13 Suppl):Abstract nr 4457.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,297
Tête enseignante GPT0,566
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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